童年時期

鳴人出生時父母雙亡，成為孤兒的鳴人因為自己體內的九尾導致自己在冷眼與孤寂中長大，但依然樂觀向上，以成為火影為目標。因為父親與面具男戰斗后得知面具男會在未來帶來威脅，再加上父親相信自己的兒子，所以把九尾、父親的查克拉、母親的查克拉封印在鳴人體內并希望鳴人在未來能夠控制九尾的力量來阻止威脅，同時希望鳴人成為村子的英雄被人善待，但事實并不如愿。

第三代火影為了保護鳴人不讓任何人知道他和他父親有關系，“漩渦”成為了鳴人的姓。被當成“怪物”的鳴人一開始并不知道自己體內封印著九尾的事情，在孤獨中成長的他想要獲得大家的關注和認可，因此經常到處惡作劇，甚至在火影巖上涂鴉，是忍者學校有名的問題兒童，經常和奈良鹿丸、秋道丁次、犬冢牙一起引發各種課堂問題。

在宇智波滅族事件后，鳴人與佐助，兩個孤獨的孩子開始互相關注起了彼此。鳴人的老師伊魯卡也非常關心鳴人的成績和生活，經常請鳴人吃拉面。

晉升下忍

鳴人在忍者學校的畢業考試，分身術的測試中考試失敗沒能通過，而忍者學校的教師水木趁機騙鳴人去偷封印之術答應讓他考試合格，然而水木的陰謀被伊魯卡拆穿，鳴人也從水木那里得知了自己體內被封印著九尾的事實，伊魯卡拼死保護了鳴人，并認同了鳴人，鳴人為了打敗水木，使用了從封印之術上學會的多重影分身之術秒殺了水木，伊魯卡將自己的護額贈予鳴人，讓鳴人通過測試成為了一名木葉的下忍。

與三代火影的孫子木葉丸相遇后，木葉丸為了打敗三代向鳴人請教色誘術，木葉丸的家教老師惠比壽對身為“妖狐”的鳴人有偏見而與鳴人爭執，卻被鳴人以后宮之術擊敗，木葉丸也決定以鳴人為目標開始努力，惠比壽經過此次事件也改變了對鳴人的看法，對鳴人表示了認可。

組成第七班

在下忍的分班配置中，鳴人、佐助和小櫻被分到了第七班，指導老師為木葉上忍旗木卡卡西，卡卡西以搶鈴鐺的演習來考驗三人的團隊合作，但三人一開始完全沒有想過配合，鳴人更是一開始就不加隱藏直接挑戰卡卡西，被卡卡西輕易抓起來，佐助和小櫻也先后失敗，由于鳴人表現最差被綁在圓木上不允許吃午飯，但佐助和小櫻卻趁著卡卡西不在把便當分給了鳴人，卡卡西突然出現，告訴三人測試合格，因為卡卡西的本意并非是考驗個人實力，而是能否打破規則幫助同伴。

波之國的任務

在組成第七班后，卡卡西帶著鳴人等人執行了許多像是抓貓、種田這樣的小任務，這讓鳴人相當不滿，三代火影于是便安排了第七班執行護送重要人物的C級任務，護送對象是波之國的橋梁建筑師達茲納。在前往波之國的途中遭遇了霧隱忍者鬼兄弟的襲擊，鳴人由于第一次與他國忍者實戰，一時恐懼導致手臂受傷中毒，被卡卡西和佐助冷嘲熱諷的鳴人心有不甘，用苦無刺向手掌放出毒血，并表示了自己不再退縮的決心。由于達茲納謊報任務情況，也導致了任務的實際難度上升到了B級（有忍者作為對手的任務最低B級起步）。

不久后他們遇到了霧隱叛忍，忍刀七人眾之一的桃地再不斬，由于實力相差過大，卡卡西讓鳴人、佐助和小櫻三人保護達茲納，自己則和再不斬交戰，卡卡西一時大意被再不斬的水牢術抓住無法行動，再不斬則使出了水分身想要解決剩下的人，鳴人自知實力無法匹敵，靈機一動想到了利用影分身和變化術的手里劍攻擊本體解除水牢的戰術，佐助也心領神會，和鳴人一同救出了水牢中的卡卡西，卡卡西脫身后擊敗了再不斬，但再不斬被一名突然出現的霧隱少年“殺死”，卡卡西也因為寫輪眼的副作用而昏倒。

來到波之國后，卡卡西指導了三人修行如何控制查克拉，由于小櫻查克拉控制能力出眾，很早就結束了修行，鳴人在從小櫻那里了解了訣竅后，和佐助一同競爭，最后兩人都能爬上樹頂。鳴人在修煉的途中，也認識了一名貌如少女的神秘少年，他告訴鳴人，人如果為了自己珍視的人，就能夠變的很強。鳴人由于修行過度疲勞睡過頭，卡卡西等人和達茲納前往大橋時就沒叫上他，而在大橋上，再不斬與之前戴面具的霧隱少年白卷土重來與卡卡西等人開戰，鳴人在趕往大橋的路上發現了沿路的奇怪痕跡，出于不放心回到了達茲納的家中，解決了黑社會老大卡多派來綁架伊那利等人的兩個手下，然后又火速趕往大橋，但魯莽的鳴人卻自行闖入了白的魔鏡冰晶中，鳴人完全不敵白的攻擊被重傷，佐助情急之下開啟了寫輪眼總算得以應付，但白卻趁機攻擊鳴人，佐助明知是計沖上去替鳴人擋下了攻擊并暈倒，鳴人誤以為佐助死亡憤怒之下首次爆發了九尾查克拉，白完全不是鳴人的對手，在鳴人準備給予最后一擊時，鳴人發現了白正是自己在森林里遇到的那位少年，白失敗后認為自己對于再不斬失去了利用價值一心求死讓鳴人殺死他，但察覺到再不斬的危險后，白來到再不斬面前，替再不斬擋下致命一擊。

后來卡多趁著兩方對戰時，帶著大量嘍啰前來準備將卡卡西和再不斬等人一舉殲滅，卡卡西和再不斬也失去了敵對的理由，但鳴人看到白的死后，忍不住的質問再不斬難道真的一點都不在乎白嗎？以冷酷鐵血著稱的“鬼人”再不斬面對鳴人的質問，還是忍不住流下了眼淚，表達了自己對白的重視，后來再不斬從鳴人手中接過苦無，殺死了作惡多端的卡多，但自己也被卡多手下的嘍啰重傷快要死去，而佐助不久后從假死中蘇醒，本次任務也宣告完成。達茲納為了感謝鳴人，將大橋起名為“鳴人大橋”，回村途中，鳴人對卡卡西說：“雖然他們是敵人，但我挺喜歡他們的。”

中忍考試

第七班返回木葉又執行了一些瑣碎的任務后，木葉準備舉行中忍考試。鳴人、佐助及櫻三人最終還是決定參加。期間小李前來向“天才”佐助挑戰，鳴人對小李目中無人的態度不爽沖上前去結果被秒殺。

第一場考試為筆試，但鳴人一題也不會做，期間坐在鄰座的雛田不希望鳴人落選而想要給鳴人看答案，但鳴人看到了其他人作弊被發現的下場后，還是決定作罷。考官森乃伊比喜公布最后一題，告知所有考生如果落選就只能當一輩子下忍，而鳴人則對伊比喜表示了自己即使只能一輩子當下忍也要成為火影的決心，鳴人的舉動鼓舞了當時還在考場的人，伊比喜判定考試留下的所有人合格。

第二場考試為死亡森林的生存試煉，在死亡森林內與其他考生爭奪用來晉級的卷軸。鳴人中途被偽裝成草隱村考生的大蛇丸的通靈獸吞進肚子，但靠著多重影分身撐破了蛇逃出生天，并趕來救援和大蛇丸對峙的佐助和小櫻，爆發出九尾力量的鳴人令眾人刮目相看，但卻還是被大蛇丸用五行封印打敗，佐助在鳴人的言行下也打破了對大蛇丸的恐懼，但還是被大蛇丸打敗并留下了咒印，鳴人和佐助兩人暈倒，小櫻則獨自照顧二人。

在小櫻等人經歷完與音忍三人組的戰斗后鳴人醒來，三人繼續考試的途中與落單的藥師兜組隊，擊敗了雨隱村的忍者后順利到達終點。參加預賽的鳴人的對手是同期的犬冢牙，牙一開始因為鳴人過去吊車尾的印象小看了鳴人，而被鳴人數次用計愚弄，甚至連搭檔的赤丸也被擊敗，冷靜下來的牙專注對付鳴人時又因嗅覺強化聞到了鳴人的屁導致無法行動，被鳴人用“漩渦鳴人連彈” 打敗。

在雛田與寧次的對決中，鼓勵了想要棄權的雛田，讓雛田堅定了決心，但雛田還是被寧次重傷，對寧次的言行感到不認同的鳴人約定與寧次下場考試再戰。

鳴人為了變強和特別上忍惠比壽進行水上行走的修行，后來遇到了自來也后進行了通靈術的修行，自來也解除了大蛇丸的五行封印，并稍微掌握了一點九尾查克拉的用法。由于過度疲憊而住院被鹿丸探望，發現了我愛羅來到木葉醫院準備殺死病床上的小李時，和鹿丸一起阻止了我愛羅。

木葉摧毀作戰

中忍考試第三場淘汰賽中，鳴人對上了日向家的天才忍者日向寧次，靠著影分身和戰術一時讓寧次有些刮目相看，但實力還是不及寧次，被寧次點穴封住了查克拉，并了解了寧次和日向家的過去。鳴人由于經過和自來也的修行，激發了九尾查克拉后與寧次戰的不相上下，最后趁著快要精疲力盡寧次不注意偷偷挖了一條地道，從地底偷襲了無力維持白眼的寧次獲得勝利，并告訴寧次命運是可以改變的。

在佐助與我愛羅的對決中，木葉摧毀計劃啟動，藥師兜使用了幻術催眠了會場大多數平民和下忍，作為計劃核心的一尾人柱力我愛羅被佐助重傷延遲了變成尾獸化的時間不得不暫時逃離，卡卡西派遣鳴人、小櫻、鹿丸和帕克去趕往我愛羅的所在地并支援佐助，后來鹿丸留下幫鳴人等人斷后，鳴人在佐助快要被我愛羅致命一擊時及時出現阻止了我愛羅，眼看著佐助虛弱，小櫻被束縛，鳴人為了保護同伴使出了多重影分身將我愛羅逼迫至完全體，鳴人在危機關頭召喚了蛤蟆文太對抗使用了假寐之術的我愛羅，利用組合變化術變成九尾短暫束縛住了一尾守鶴，并打醒了我愛羅解除了假寐之術，最后鳴人成功打敗了我愛羅，在知道小櫻得救后，鳴人放心的暈倒了過去，我愛羅也在戰斗被鳴人的言行所打動，解開了心結。

五代目火影

毀滅木葉事件結束后，由于三代火影戰死，火影一職空缺，無心擔任火影的自來也決定出村尋找同為“三忍”的綱手，并帶著想要修行新術的鳴人一同前往。

自來也在旅行途中教導了鳴人由第四代波風水門自創的A級忍術螺旋丸，終于見到綱手后，聽到綱手侮辱火影的鳴人趕到憤怒而要與綱手決斗，由于實力差距鳴人慘敗，但面對鳴人絕不放棄的精神和想要成為火影的夢想，綱手想到了自己有著同樣夢想的已故的弟弟和初戀，并與鳴人約定如果三天學會螺旋丸就把自己戴著的初代火影遺留的項鏈贈送給鳴人。

后來綱手與大蛇丸、藥師兜開戰，自來也帶著鳴人與靜音前來支援，自來也和大蛇丸展開戰斗，綱手由于恐血癥一時間無法戰斗，靜音也被藥師兜擊敗，鳴人便為了保護綱手與兜交戰，面對實力明顯在自己之上的兜，鳴人舍身抓住了兜拿著苦無的手，并使出了完整的螺旋丸重傷了兜，但自己卻被兜趁機用查克拉手術刀切斷心肌，后來被綱手治療得以活下來。綱手遵守約定，將項鏈贈予鳴人，并鼓勵鳴人一定要成為火影。

佐助奪還

佐助被再次出現的鼬所擊敗，并因鳴人突飛猛進的實力感到了焦躁，迫切想要獲得力量復仇，被大蛇丸派遣的音忍四人眾勸誘離開了木葉投奔大蛇丸。隔日綱手由于木葉處于復興期，大多上忍和中忍在外執行任務而派遣了由鳴人、鹿丸、牙、丁次和寧次組成的小隊前去追回佐助，鳴人面對小櫻的請求，答應小櫻一定會把佐助帶回來。

丁次、寧次、牙、鹿丸和后來趕來支援的小李、我愛羅、勘九郎和手鞠都拖住了大蛇丸手下的音忍五人眾，鳴人在終結之谷追上了佐助，兩人展開了對決，最終鳴人進入一尾狀態與咒印狀態二的佐助，以螺旋丸和千鳥進行了最終的對決，佐助略勝一籌，打敗了鳴人后前往了音隱村。鳴人為了變強并帶回佐助，與自來也一同離開村子踏上修行之旅。

風影奪還

經歷了兩年多的修行后鳴人和自來也一同回到了木葉村，與小櫻和卡卡西重新組成第七班。不久后木葉方面受到了砂隱村的求援，任務內容是營救成為風影的我愛羅，鳴人等人和手鞠一同動身前往砂隱村，在小櫻救治了勘九郎，了解了敵方一定的情報后，第七班與砂隱村的顧問千代婆婆一同前去救援我愛羅。途中第七班遭遇了宇智波鼬的象轉分身的阻攔，經過一番交戰后，鳴人和卡卡西擊敗了鼬的分身。

在和第三班回合后來到曉的根據地，但我愛羅因為尾獸被抽離而死，迪達拉利用我愛羅的遺體挑釁鳴人將鳴人引開，卡卡西為了協助鳴人也跟隨鳴人一起追趕迪達拉，后來在和卡卡西的配合下戰勝了迪達拉，奪回了我愛羅，但卻被迪達拉使用黏土替身逃離，憤怒的鳴人一度爆發尾獸外衣，但被卡卡西使用自來也給的封印符阻止。

鳴人因為我愛羅的死而悲痛，千代婆婆被鳴人的真摯所打動，于是以自己的生命為代價使用轉生忍術復活了我愛羅，鳴人與我愛羅結下了深厚的友誼。

天地橋的戰斗

在營救風影的任務中，小櫻從曉的成員蝎那里得知了自己會在數日后，與自己派遣在大蛇丸手下的內應會和，木葉方面也決定出動與其接觸。由于卡卡西因為在上一次戰斗使用了萬花筒寫輪眼導致了極大的副作用而臥床休養，由火影直屬暗部，擁有初代火影細胞的木遁忍者大和暫時代替卡卡西成為第七班的隊長，團藏手下的暗部組織“根”的成員佐井也作為替補成員加入，四人組成小隊前往天地橋。由于佐井是接受過團藏的感情抹殺訓練，不懂人情世故，因此在鳴人和小櫻面前說了佐助不少壞話，這使得鳴人一開始對佐井有著嚴重的不滿。

來到天地橋后，大和變化成蝎的樣子赴約，但卻發現了對方是藥師兜，隨即演變成了第七班不得不與大蛇丸和兜對峙的局面，鳴人在大蛇丸的挑釁下，憤怒的進入了尾獸外衣狀態與大蛇丸交戰，后來演變成第四條尾巴，失去自我意識暴走的鳴人與大蛇丸展開了一場惡戰，面對四條尾巴的鳴人，大蛇丸也有些難以應付，大和為了阻止鳴人進一步暴走，使用了初代火影的秘術將鳴人的尾獸化抑制住，鳴人因為尾獸衣的反噬而暈倒，后來得知了自己在暴走中誤傷了小櫻而感到內疚，在大和的勸導下，決定不斷修煉，保護身邊的人。

與佐助的再會

佐井作為團藏的部下，在與大蛇丸交涉后，跟隨大蛇丸和兜來到了根據地，大和通過事先在佐井身上設置的木遁發信器，找到了大蛇丸的巢穴，并抓住了背叛的佐井，佐井問鳴人為何要對佐助如此執著，鳴人表示自己與佐助之間有著兄弟般的“羈絆”。佐井其實是“根”派來刺殺佐助的殺手，但受鳴人感動，回想起了自己沒有血緣關系的哥哥，最終決定協助七班拯救佐助。

鳴人和小櫻終于見到了佐助，但佐助冷酷的態度和突飛猛進的實力與過去判若兩人，佐助稱要把鳴人殺掉，以斬斷彼此間的“羈絆”，并了解到佐助即使可能成為容器也要復仇的決心。在佐助準備下殺手時被大蛇丸阻止，大蛇丸說要留著鳴人等人去解決更多曉的成員，佐助、大蛇丸和兜離去，任務失敗，雖然沒有追回佐助，但鳴人獲得了佐井這個新伙伴。

不死二人組

回到木葉和卡卡西交流了關于天地橋的任務后，為了彌補鳴人與佐助的實力差距，在卡卡西的指點和大和的幫助下，開始了將風遁的性質變化加入螺旋丸的修行，并接受了擅長風遁的猿飛阿斯瑪的指點。

后來阿斯瑪在與曉組織成員飛段與角都的戰斗中犧牲，卡卡西把修行之事交給大和、而自己則成為了第十班的代理隊長，協助第十班向飛段和角都復仇。在卡卡西等人與角都激戰中，鳴人、大和、小櫻和佐井趕來支援，鳴人使用在修行中開發的新術“風遁·螺旋手里劍”擊敗了角都，但右手因為副作用而受傷，回村后綱手將此術列為禁術，禁止鳴人使用。

追捕宇智波鼬

大蛇丸被佐助“殺死”的消息很快傳遍忍界，鳴人為了找到“曉”和佐助的下落，向綱手提出把目標鎖定為宇智波鼬。木葉派出第七班和第八班執行這個任務，期間鳴人遇到了鼬，鼬告訴鳴人自己只是前來交談沒有敵意，在幻術中確認了鳴人想要拯救佐助的決心后，將裝有止水寫輪眼的烏鴉放進了鳴人體內，并希望使用這個力量的那天不要到來。鼬此舉是防止佐助復仇成功后受人蠱惑危害木葉，屆時就能以幻術“別天神”修改佐助的意志，使其守護木葉。

在尋找途中，鳴人等人遭到了曉組織的面具男阿飛的阻攔，眾人的攻擊對他無效，最終拖延到鼬和佐助對決結束后和絕一同離開，離開前自稱為“宇智波斑”，先行帶走了昏迷的佐助，任務以失敗告終。

佩恩入侵

鳴人回到木葉，得知自來也被佩恩殺害的噩耗。為此曾一度悲傷的他，在伊魯卡和鹿丸的鼓勵下再度振作，并協助暗號班破譯自來也留下的暗號。

為了變強對抗曉，鳴人前往妙木山修行仙術。不久后佩恩入侵木葉想要抓住身為九尾人柱力的鳴人，并對木葉村大肆破壞，得知鳴人不在村內后，佩恩使用了超大型的“神羅天征”將木葉幾乎夷為平地。學成仙術后的鳴人回到了被破壞的木葉村，與佩恩六道展開戰斗，由于學會仙術實力大增，螺旋手里劍的缺點也完全彌補，變得可以扔出，加上多位妙木山蛤蟆的協助，在天道因為使用了神羅天征力量沒有恢復的時間里解決了多位佩恩，第五個佩恩餓鬼道也因為吸收了鳴人的仙術查克拉無法控制而蛙化，但面對恢復了力量的最強的天道，還是無法匹敵，鳴人被天道抓獲，雛田為了保護鳴人挺身而出并向鳴人告白，但還是被佩恩擊敗，誤以為佩恩殺死了雛田的鳴人情緒失控，在一瞬間爆發九尾查克拉，變成了六條尾巴的狀態，天道一時間敵不過不得不使用了地爆天星抓住鳴人，卻被鳴人變成第八條尾巴突破。

正當鳴人快要變成第九條尾巴時，波風水門留在鳴人體內的查克拉出現，制止了鳴人撕開封印。鳴人在水門口中得知了自己身世，水門在使用僅剩的查克拉重新修復了封印后消失，鳴人從地爆天星中脫離，以仙人模式和天道展開最后的較量，在使用了多重影分身加變化術的連續誘敵后，抓住了佩恩無法使用神羅天征的五秒空隙，以螺旋丸擊敗天道。并通過佩恩身上的查克拉接收器感知到了佩恩本體的所在地，見到了長門和小南。在了解了長門的身世后，兩人就實現和平這一點展開了交流，最后長門被鳴人所打動，決定把實現和平的理想寄托在鳴人身上，以生命為代價使用了“外道·輪回天生之術”，復活了所有在這次的入侵中死去的人。回到村子的鳴人得到了全村人的認可，被當作英雄崇拜。

五影會談

佐助在知道鼬的真相后與曉組織聯手抹殺木葉高層，鳴人得知此事后想要阻止佐助，與卡卡西、大和一同前往鐵之國，找到了準備參加五影會談的雷影，請求雷影對佐助網開一面，但遭到了雷影的強烈抗拒。在旅館住宿時，遇到了特意來找他的面具男，卡卡西和大和趕來包圍了面具男后，鳴人激動的質問面具男對佐助有何企圖，面具男便對鳴人等人說出了宇智波滅族事件的真相，并聲稱現在的佐助已經被仇恨所支配。

由于小櫻對鳴人答應她找回佐助的約定感到愧疚，想要獨自殺死已經成為了罪犯的佐助，和佐井、小李、牙一起來到鳴人面對，對鳴人告白，勸鳴人放棄追回佐助這件事，而鳴人看穿了小櫻在說謊便拒絕了她，并告訴小櫻想要追回佐助是他自己的意愿。后來佐井偷偷留下了分身，告訴鳴人等人同期的忍者決定刺殺佐助，以及小櫻此舉的動機，不久后我愛羅也趕到，告知鳴人佐助大鬧五影會談以及“斑”準備發動第四次忍界大戰的事情，接連的消息一時間讓鳴人有些難以接受，出現過度呼吸癥而昏迷。

佐助在殺死團藏后，小櫻和卡卡西先后找來，卡卡西救下了差點被佐助攻擊的小櫻，并和佐助對決，戰斗中由于佐助過度使用萬花筒寫輪眼導致了視力受損，小櫻準備趁機殺死佐助但卻下不了手，反而被佐助抓住，卡卡西因為在戰斗中使用了萬花筒寫輪眼而動作遲緩，千鈞一發之際，鳴人趕來救下了小櫻，鳴人想要勸導佐助，但不被佐助接受，兩人再度交戰，以螺旋丸對決千鳥，雙方不分勝負，鳴人對佐助表示他不再阻止他復仇，但前提是由他來當佐助的第一個目標。佐助說了句“那么就先從你開始殺吧”，和“斑”一起用時空間忍術離去。

事后鳴人等人帶著被佐助拋棄的香燐回到木葉，被香燐評價其查克拉“明亮而溫暖”。鳴人察覺到了佐助與自己冥冥之中有某種聯系，對伙伴們說能夠和佐助戰斗的人只有自己。

龜島試煉

鳴人回村后不久被召喚到妙木山，從大蛤蟆仙人處得知了預言，暗示未來會遇到八尾人柱力奇拉比、以及與佐助的對決。由于五影會談上，五影為了保護鳴人和奇拉比兩位人柱力不被敵人抓走，以修行為由安排鳴人和奇拉比前往龜島。

鳴人獲得了奇拉比的認同后，由比對鳴人展開了掌控尾獸化的指導，二度面對真實瀑布中內心的黑暗面，最終感化了黑暗鳴人，得已進行進一步的修行。在比和八尾牛鬼的協助下，鳴人進入內心深處與九尾對峙，搶奪九尾的查克拉，但在查克拉拔河的過程中，由于九尾的查克拉中帶有太多的憎恨險些將鳴人吞噬，這時鳴人的母親漩渦玖辛奈出現在鳴人的意識中，幫忙控制住了九尾，在玖辛奈的幫助下鳴人成功壓制九尾，獲得了九尾的查克拉并加以控制。后來玖辛奈告知了鳴人自己的身世、自己是前代九尾人柱力的身份以及十六年前九尾之亂的真相。鳴人謝過母親并承諾成為超越父母的忍者，返回了現實世界。

鳴人回到現實后向比和大和展示了九尾的查克拉模式，這個狀態下的鳴人擁有感知惡意的能力，因此發現了潛藏在比身后的大刀鮫肌中的鬼鮫，行跡敗露的鬼鮫準備逃離龜島將情報傳遞出去，鳴人及時阻止了鬼鮫進行了神速的一擊，但因為第一次進入狀態，無法完美控制力量導致了腳被卡住，鬼鮫趁機繼續向外逃跑（后來鬼鮫與邁特凱激戰，被凱所擊敗，為了不泄露曉的情報鬼鮫自盡并使用通靈術將情報傳遞了出去）。后來鳴人繼續跟著比進行尾獸模式的修行。

第四次忍界大戰

在第四次忍界大戰的戰場上，穢土轉生的云隱村叛忍金角由于生前曾吞食過九尾的肉，獲得了九尾的查克拉，在戰場上使用半尾獸化時的查克拉被遠在龜島的鳴人感知到，這使得鳴人意識到外界的動靜，遂決定與比一同離開龜島前往戰場，伊魯卡本想阻止，但阻止無果的他給鳴人留下了一封信，祈禱鳴人能夠平安歸來。在前往戰場的路上，鳴人遭到了雷影和綱手的阻攔，鳴人面對雷影的全力一擊，以堪比“黃色閃光”的神速避開了攻擊，雷影也不再阻止，讓鳴人和比參與了戰斗。

不久后，鳴人和比遇到了被兜派來捕捉八尾和九尾的穢土鼬和長門，雙方展開了交戰，鳴人和鼬互相確認了關于滅族的真相和佐助的現狀后，鼬決定將佐助托付給鳴人。隨著戰斗逐漸激烈，鼬使用了萬花筒寫輪眼，與鼬曾經留在鳴人體內的裝有止水眼睛的烏鴉相呼應，觸發了幻術“守護木葉”，解除了穢土轉生對自己的支配權，兜見狀完全操縱了長門與三人戰斗，面對長門的地爆天星，鼬和鳴人、奇拉比各自使出了最強的遠程攻擊破解了地爆天星，鼬以十拳劍封印了長門，長門臨別之際將希望托付給鳴人，含笑而別，鼬看見想要獨自背負、解決一切的鳴人后點醒鳴人：“不是成為火影就能被大家認同，而是被大家認同的人才能成為火影”，然后鼬接下了解除穢土轉生的任務告別了鳴人和比。

鳴人使用了影分身支援各個戰場，并協助我愛羅和大野木成功擊敗了二代土影、三代雷影，忍者聯軍的戰況因為鳴人的援助得到好轉，然而兜也使出了殺手锏，用穢土轉生召喚了真正的宇智波斑。面對斑那壓倒性的強大，鳴人、我愛羅和大野木費勁全力才得以勉強維持住戰線，綱手、照美冥和艾在得知斑的消息后也立刻趕往戰場與五影展開對決，鳴人在受到五影的托付后解除了影分身。而鳴人本體這邊則與面具男、六位穢土轉生的人柱力遭遇，寡不敵眾的鳴人和比處于劣勢，卡卡西和凱及時趕來支援，在戰斗中鳴人一度進入了尾獸們的內心，獲得了眾尾獸和人柱力們的認可，并得到了六只尾獸的部分查克拉，九尾也被鳴人真誠的為尾獸著想的舉動給打動，與鳴人和解，完成了第一次真正的尾獸化。面具男準備提前復活十尾，鳴人等人也為了阻止面具男而積極的發起攻勢，在戰斗中，卡卡西注意到面具男立于不敗的時空間忍術的特點，并利用神威協助鳴人打破了面具男的面具，面具之下的面孔，正是卡卡西的昔日摯友宇智波帶土。

解除了穢土轉生契約的斑擊敗了五影，與帶土聯手，并成功復活了不完整的十尾。忍者聯軍也趕來協助鳴人對抗十尾，但面對十尾超過想象的強大力量，聯軍方也損傷慘重，寧次甚至為了保護雛田和鳴人而犧牲，這使得鳴人在帶土的質問中一度動搖和絕望，但在雛田的安慰和九尾的訓斥下使他恢復了精神。鳴人把九尾再次制造的查克拉調整成適合每個忍者的類型，輸送到忍者聯軍每個成員身上。

滿月的戰場

鳴人和忍者聯軍面對斑、帶土、十尾強大的攻勢陷入苦戰，而這時被穢土轉生的四位火影以及佐助、大蛇丸和鷹小隊成員也紛紛趕來戰場進行支援。四位火影以四赤陽陣控制住十尾，使十尾的尾獸玉自食其果，鳴人、佐助、小櫻，第七班集結，聯手同期忍者一同對抗十尾的分裂體。帶土由于在時空間中與卡卡西對決受了重傷，從時空間中出來，并吸收了十尾，成為了十尾人柱力。成為十尾人柱力的帶土異常強大，即使是各位火影和鳴人佐助的聯手攻擊也拿他毫無辦法。蛤蟆吉由于召喚時間快要結束對帶土使用了帶仙術查克拉的攻擊，被帶土防御，這令鳴人和千手扉間察覺到仙術攻擊對十尾人柱力能夠產生作用的特點，在扉間的飛雷神之術的配合下，鳴人的仙術螺旋丸成功擊中帶土。

帶土為了使用無限月讀釋放出神樹，利用神樹將大量的聯軍忍者的查克拉吸收到枯竭，面對再一次的打擊，鳴人險些動搖之時，在佐助的話語下重拾斗志，與佐助聯手對抗帶土，最后二人聯手使用“威裝·須佐能乎”對戰十尾人柱力宇智波帶土，在二人的努力以及其他忍者聯軍的配合支持下，帶土終于被擊敗，其體內的眾尾獸被成功救出。而帶土也由于在內心世界中與鳴人的對話，回想起最初的夢想被鳴人感化。

大戰六道斑

在鳴人等人與帶土對決的時候，千手柱間和宇智波斑也在交戰，柱間用木龍之術和明神門束縛住了斑，鳴人和佐井本準備協助一起封印斑，而斑卻伺機而動，利用黑絕控制了想要使用輪回天生之術復活忍者聯軍的帶土，將施術對象轉為自己，斑因此復活，并準備捕捉九只尾獸。在白絕為斑送來了被帶土藏起來的另一只輪回眼后，斑使用輪回眼的力量一瞬間擊敗九只尾獸，并使用外道魔像將其全部抓住，斑因此成為十尾人柱力，而鳴人體內的九喇嘛被抽出，生命垂危。我愛羅受九喇嘛之托將鳴人帶向擁有另一半九尾查克拉的波風水門所在的地方，并讓小櫻使用醫療忍術設法延續鳴人的生命，但水門的九尾查克拉又被中途出現的黑絕奪走。

后來帶土恢復自我意識控制住了黑絕，并從斑體內搶走了一部分一尾和八尾的查克拉，來到時空間為鳴人輸送尾獸們的查克拉，至此鳴人獲得了九只尾獸的查克拉。鳴人在精神世界中遇到了被稱為“六道仙人”的大筒木羽衣，了解了一切的起源并得知自己是羽衣次子阿修羅的轉世，在與羽衣進行一番交流后，鳴人和佐助兩人在選擇了各自的道路并接受了羽衣的力量。蘇醒后的鳴人獲得了用于封印的術式“陽之力”，以及六道仙術的力量，掌握了六道仙人模式。

獲得六道力量的鳴人實力有了飛躍性的提升，一腳踢開了六道斑準備殺死凱的求道玉，并救活了使用了“八門遁甲之陣”即將死去的凱，趁著斑還未完全恢復，鳴人使用發起進攻重創六道斑并切開了神樹，開啟輪回眼的佐助趕來后，兩人一同對抗吸收了神樹的斑。斑一時不敵，趁機搶走了卡卡西的寫輪眼使用神威進入了帶土的時空間，并取回另一只輪回眼，發動大量的地爆天星對付鳴人和佐助以拖延時間，趁機使出了無限月讀并使用“神·樹界降臨”將所有陷入幻術的人用樹木包裹吸收其查克拉。而活人里，鳴人、小櫻和卡卡西受到擁有輪回眼的佐助的保護，帶土被黑絕附身，得以避免了被無限月讀控制。

封印輝夜

無限月讀的光照結束后，鳴人等人與斑對峙時，黑絕從背后突襲貫穿了斑的身體，借助斑的身體復活了查克拉之祖——大筒木輝夜。鳴人和佐助試圖阻止，卻不敵輝夜那超乎想象的龐大查克拉，輝夜為了奪回所有的查克拉，將第七班和帶土轉移到了熔巖空間，鳴人為了制造封印輝夜的破綻，使用了色誘·逆后宮之術，但就在兩人的手即將觸碰到輝夜時，輝夜又將所有人轉移到寒冰空間，阻止了兩人。

在黑絕的提議下，輝夜決定將兩人分開對付，佐助被輝夜送到了沙漠空間，帶土由于被鳴人注入了陽遁之力而得以延續了生命，醒來后決定協助第七班將佐助帶回來，鳴人本體負責拖住輝夜，派出了分身和帶土、小櫻一起將佐助找回。黑絕提議直接將鳴佐二人殺死，輝夜將所有人轉換到超重力空間，以重力束縛所有人的行動，并對鳴佐二人使出了必殺之術“共殺灰骨”，卡卡西和帶土為了救下二人自愿上前替兩人抵擋攻擊，但帶土使用了神威救下了卡卡西，自己即將死去。帶土死前對鳴人說：“你一定要成為火影啊”后含笑而終，面對嘲諷帶土的黑絕，憤怒的鳴人沖上前去卸下了輝夜附著黑絕的手臂。

鳴人和佐助再度聯手對抗輝夜，鳴人使用了九種尾獸查克拉制造的超尾獸螺旋手里劍攻擊輝夜，引起了輝夜體內尾獸的共鳴，輝夜體內的尾獸查克拉開始不受控制而暴走。輝夜使用了足以毀滅世界的膨脹求道玉，打算重新創世，就在這時，卡卡西由于被帶土的查克拉附身，獲得了雙眼的萬花筒，并開啟了須佐能乎完成體，第七班在卡卡西的指揮下展開了精妙的配合，輝夜企圖用共殺灰骨殺死兩人，但鳴人那邊的共殺灰骨的空間被卡卡西用神威關閉，佐助那邊則是由鳴人的分身變化而成，佐助使用了天手力替換了被攻擊的分身，輝夜一時心急向向上方逃離，被空中的小櫻一拳阻止，三人成功抓住了輝夜，鳴佐使用了“六道·地爆天星”將輝夜和黑絕封印。

輝夜被封印后，大筒木羽衣召集歷代五影（除火影）的靈魂共同施術，將所有人、尾獸召回了忍者世界，隨后羽衣解除了穢土轉生，而這一天也是鳴人的17歲生日，鳴人連忙趕到水門的面前，水門微笑著向鳴人祝賀“生日快樂”，鳴人流淚著向水門說出了之前沒能說出的各種話語，并希望水門能將這些話語傳達給母親。水門說“我一定會傳達給她的”，之后水門的靈魂回歸凈土。

和解之印

羽衣希望鳴人和佐助協力解除無限月讀，但佐助突然揚言要發動革命，準備處刑現任五影，隨即用幻術控制住九只尾獸，并使用地爆天星將其封印。鳴人為了阻止佐助，兩人來到了終結之谷，進行最后的決戰。

佐助否認了鳴人追求和平的方式，認為要真正實現和平，應獨自背負著全世界的仇恨，使忍界有一個公敵，才能讓人們團結起來。而鳴人是他現存唯一的羈絆。只有親手殺死鳴人，才能完成這個目標。

身為忍界巔峰的二人展開了勢均力敵的對決，激戰的過程甚至將終結之谷毀壞，柱間和斑的雕像被摧毀。從白晝到黃昏，即使精疲力盡兩人也在互毆，最終佐助使出了千鳥加加具土命，鳴人用最后的查克拉使出了螺旋丸，雙方的慣用手臂在招式的碰撞中被打斷。

重傷的二人先后醒來，佐助看到即使拼上性命也要阻止自己的鳴人，表達了自己的不解，并有著自我了斷贖罪的打算。而鳴人告訴佐助自己早已將他視為伙伴，所以無論如何都會分擔他的痛苦，阻止他身陷黑暗。佐助聽著鳴人的話語，回想起與鳴人的點點滴滴，在內心中為觀眾訴說了自己一直以來隱藏的心聲，流下眼淚，最后笑著承認這場對決是自己輸了。后來小櫻和卡卡西趕來為二人療傷，鳴人佐助解除了無限月讀，救出了陷入幻術中的人們。

返回村里休養直至康復后，佐助告知卡卡西和櫻他即將再度啟程，遠行他方看一看曾經因為自己被仇恨蒙蔽了雙眼而錯過的人和事。佐助婉拒了櫻希望與之同行的請求，并答應自己會再度歸來。才離村沒多久，鳴人出現在佐助的面前，把當初被自己用螺旋丸劃過的木葉護額還給佐助。佐助收下護額，承諾履行忍者的職責，兩人就此告別。

成為火影

戰后，卡卡西接替綱手成為第六代火影，而若干年后，鳴人也接替卡卡西成為第七代火影，完成了兒時夢想。與日向雛田結為夫妻，并育有一子一女。

在鳴人當上火影的那一天，她的女兒向日葵想帶著一只玩具熊貓去參加父親鳴人就任七代目火影的儀式，但博人因感覺丟人而不同意，結果兄妹在爭執之下把玩具熊貓扯成了兩半。向日葵在憤怒之下覺醒了白眼，痛擊博人。鳴人趕過來勸架，卻挨下了向日葵對哥哥的瞬間休克性點穴，一整天都無法醒來。顧問奈良鹿丸最后只好安排猿飛木葉丸變成鳴人的樣子，讓木葉丸代替鳴人完成了七代目火影就任儀式。（外傳短篇漫畫劇情）

在新一屆五影會談中，由奈良鹿丸擔任鳴人的護衛和輔佐。至此，原作漫畫的劇情完結。

七代目火影與緋色的花月

距離戰后已經15年，新生代忍者的年紀也如同鳴人當年剛成為下忍那時一般大。佐助在村外執行機密任務時，遇到了擁有寫輪眼的謎之少年，將消息通報給鳴人，鳴人和卡卡西商討后認為該少年和大蛇丸有關，決定親自前往與佐助匯合，而佐助的女兒宇智波佐良娜為了見到自己從未見過面的父親佐助，和朋友秋道蝶蝶一起偷偷跟在鳴人后面，但兩人在途中被自稱宇智波信的寫輪眼少年襲擊，鳴人及時趕到救下二人，信見不敵鳴人也趕緊撤退，為了保護二人，鳴人便帶著佐良娜和蝶蝶一起行動，而佐良娜也在與鳴人的相處中感受到了安心和溫暖，鳴人也在休息的時候和佐良娜談起了自己和佐助的一些事情。

與佐助匯合后不久，真正的宇智波信帶著他的克隆人一起向鳴人和佐助發起偷襲，由于輕敵導致鳴人被信的萬花筒能力所傷，佐助也由于長期調查時空間，瞳力沒有恢復完全而受傷，緊要關頭小櫻出現將信一拳重傷，在原第七班成員集結并交談時，信趁機用自己制造的小克隆體發動時空間忍術，將自己、克隆人和小櫻帶回了自己的根據地，為了尋找小櫻和信的下落，鳴人等人決定尋找大蛇丸。從大蛇丸口中，鳴人等人得知信曾是大蛇丸的實驗體，并且相當崇拜宇智波鼬，但非宇智波一族的人，由于他不會對移植的器官產生排異反應的特殊體質，他的手臂也被用來為團藏移植寫輪眼。

在大蛇丸的基地，由于佐良娜因為誤會以為小櫻不是自己的親生母親感覺到自己被欺騙，甚至有離開木葉的想法，但在鳴人的安撫下，佐良娜回想起小櫻一直以來對自己的母愛，決定和鳴人一起前去信的根據地一起去救出小櫻。

鳴人、佐助等人前往信的根據地展開襲擊，鳴人為了不傷人只是使出了多重影分身將大量的信的克隆人一一制服，最后宇智波信被克隆人背叛而死，鳴人將所有克隆人帶回木葉，送到了藥師兜在木葉開設的孤兒院進行管教。

經過此次事件中鳴人的教導，佐良娜心中對忍者的定義的疑惑亦一同消除，于是以鳴人為榜樣，希望成為能夠幫助村中所有人的火影。

博人傳

中忍考試正式開始后，由于博人使用科學忍具作弊，結果作弊的博人被鳴人當眾揭發，并取消了博人的忍者資格。

桃式和金式突然降臨考試會場大肆破壞，面對能夠吸收和加倍反彈忍術的桃式，鳴人全力保護村民后落敗并被他們倆抓走。

被救出后和佐助一起對付已經吸收金式的桃式。削弱桃式后，博人打敗桃式。

讓博人再次擁有忍者資格。

收留和監視川木。

當一式想要帶川木回去時，鳴人拒絕他的要求，結果鳴人與一式在異空間戰斗。即使有佐助的支援，鳴人和佐助還是不敵一式，結果鳴人被一式封印；佐助受重傷暫時撤退。最后鳴人被博人、佐良娜、巳月、川木拯救。

后在阿瑪多的半威脅下達成保護阿瑪多的請求，從而得知了大筒木一式的目的以及殼組織的背景，與眾人透過監視的忍蛙看見一式復活的過程，以及一式與果心居士的戰斗。于一式再次來到木葉后與之進行戰斗，與佐助被博人透過楔傳送至異空間，并與一式展開戰斗。

由于三人戰斗處于下風，鳴人與九喇嘛商討對應方式，并決定不惜犧牲性命，開啟了九喇嘛口中的「究極奧義」模式。

開啟的「重粒子模式」是以鳴人和九喇嘛的查克拉為「原料」一邊消耗而制造出的力量，會持續直到兩者生命耗盡之時。后以驚人的速度及力量輾壓一式，但隨著戰斗時間越長，自身力量也逐漸減弱。