在以下的攻略中將著重介紹游戲的全部流程以及精彩的劇情，由于《英雄傳說》系列從來都不是以戰斗難度來考驗玩家，因此游戲中的絕大多數戰斗都沒有太過變態的難度，少量難度偏大的戰斗將會在攻略中加以介紹。此外游戲中還有比較完善的地圖系統，城市地區和野外場景基本上都可以呼出地圖查看自己的所在位置，而且城市中不同的設施還用專門的顏色表示了出來，因此攻略中對于如何前往店鋪、旅館等設施不予說明，而且游戲中的迷宮難度也都不大，玩家們可以自行研究一下。

　

　　 天已經黑了，エステル還在等著身為游擊士的父親カシウス回來，不想父親回來的時候還抱著一個黑發的小男孩，并且決定收養他，從此三人開始了一起的生活。
　　 一轉眼エステル和當年的黑發男孩ヨシュア已經在カシウス的教導之下修行了5年，這天カシウス讓兩人前往ロレント市進行準游擊士測試，同時帶一份名為“リベール通信”的雜志回來。從家里出來后沿著小路走很快就可以到達ロレント市，雜貨店的店主說リベール通信還沒來，不過他送了一份料理清單給エステル，以后只要是品嘗過的料理，具體的制作方法都會被記錄在這份清單上。來到游擊士協會的二樓和シェラザード對話，閑聊一番后她就帶著兩人下樓找アイナ去拿游擊士手冊，并且告訴エステル可以從游擊士協會里接受各種各樣的任務來提升自己的準游擊士階級，當然完成任務之后不要忘記向アイナ報告。
　　 介紹完游擊士協會之后，シェラザード把兩人帶到了結晶工房介紹結晶回路的合成以及導力器的使用方法，把シェラザード提供的七耀石碎片合成為“HP1”，然后裝備到エステル身上，再和シェラザード對話就可以完成結晶回路的知識介紹。看到エステル已經掌握了游擊士的基本知識，シェラザード安排了最后一項測試，就是從下水道中找到一個箱子，然后把箱子里的東西帶回游擊士協會。
　　 シェラザード把兩人帶到了下水道的入口處，接下來就要看エステル和ヨシュア的本事了，其實下水道里的敵人很弱，而且這里還有回復裝置，可以迅速回復HP和EP，因此戰斗是相當輕松的，在下水道左下角有一個由怪物看守著的箱子，消滅怪物打開箱子會發現兩個小箱子，這就是シェラザード要的東西。帶著兩個小箱子返回游擊士協會，先向アイナ報告任務的完成情況，然后上樓與シェラザード對話，原來這兩個小箱子里面就是準游擊士的紋章，也就是說エステル和ヨシュア已經順利的通過了準游擊士的測試，正式跨入了準游擊士的行列。

　　 看看時間已經不早了，兩人來到雜貨店買到リベール通信后準備回家，剛要離開ロレント市時アイナ叫住了他們，原來城里的兩個小孩子パット和ルック跑到了經常有魔獸出沒的翡翠之塔，于是エステル和ヨシュア就接受了成為準游擊士之后的第一項任務：營救誤入翡翠之塔的パット和ルック。從ロレント市北面出口出城沿著マルガ山道前進，中途向西的岔路口就通向翡翠之塔，剛走進翡翠之塔就聽見了兩個小孩子的對話，生氣的エステル就在翡翠之塔的入口大吼了起來，但是一點回應也沒有，兩人之后繼續往翡翠之塔的上層前進。來到二層就聽見了兩個小家伙的呼救聲，這里選擇和ヨシュア一起突進吧，隨后進入與魔獸的戰斗，這里一定要保護兩個小孩不能被打倒，盡快消滅敵人才是關鍵。解決掉魔獸之后エステル忍不住要教訓一下パット和ルック，沒想到一只魔獸突然從自己身后出現撲了上來，千鈞一發之際老爹カシウス趕到，一擊就干掉了魔獸，當然他也不會錯過這個給エステル和ヨシュア上課的好機會。
　　 カシウス要送パット和ルック回家，因此讓エステル兩人自己去游擊士協會報告，正好アイナ也有一封從外國來的信件要交給カシウス，順便就拜托給エステル了。回家之后把リベール通信和那封信都交給父親，結果晚餐的時候父親說明天一早就要離開，不過由于他在ロレント市的游擊士協會接受了一些任務，因此這些任務都落到了エステル和ヨシュア身上。深夜エステル已經進入了夢鄉，カシウス一個人坐在院子里沉思，這時睡不著的ヨシュア走了過來詢問那封信的事情，原來這件事和エレボニア帝國有關，所以カシウス要前往王都的帝國大使館調查一些事情。

序章　父、旅立つ
　　 次日清晨，エステル、ヨシュア還有シェラザード將カシウス送上了前往王都グランセル市的定期飛行船，隨后來到游擊士協會看看有什么可以接受的任務，アイナ告訴他們パーゼル農園有魔獸出沒，農園主希望有游擊士可以去幫助他們解決這一難題。

　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受兩個分支任務“光る石の搜索”和“ミルヒ街道の手配魔獸”。）
　　 光る石の搜索：先到結晶工房西側門外和カレル對話，他說自己喜歡的光る石在雜貨店的門口掉了，希望エステル可以幫他找找，來到雜貨店門口搜索，調查排水口會發現從下水道里有光亮發出來，于是從禮拜堂后的入口進入下水道調查（就是完成準游擊士測試的下水道），拿到光る石交給カレル即可完成任務。
　　 ミルヒ街道の手配魔獸：出城后沿著ミルヒ街道前進，在第三個場景西北方向會發現一只名為“パインプラント”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　來到パーゼル農園，和ティオ對話得知魔獸只會在晚上出現，于是兩人決定吃過晚飯再來仔細搜索。夜幕降臨后エステル和ヨシュア開始調查整個農園，首先會在牛棚里發現魔獸的蹤跡，不過魔獸警覺性很高，察覺到有人就跑開了，隨后在溫室里、菜地里都看到了魔獸，最后在溫室前面終于堵住了魔獸，開始戰斗。打敗魔獸之后會讓玩家決定如何處置它們，看在它們沒做什么太可惡的事情，放過它們就行了。返回游擊士協會報告，アイナ又說クラウス市長又提供了新任務，具體的任務細節市長會詳細說明。來到市長宅邸和クラウス市長對話，原來他希望エステル兩人可以去マルガ礦山，從礦山長手里拿回七耀石并且安全的帶給市長。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受四個分支任務“キノコ狩リ”、“街道燈の交換”、“藥の材料采集”和“兵士訓練”。）
　　 キノコ狩リ：在飛行船場的オーヴィッド先生想得到“ホタル茸”，這是一種生長在マルガ山道上的草狀物，前往マルガ山道的第三個場景，在東北方的草叢里可以發現這種植物，但是這里居然有魔獸，消滅魔獸之后就可以順利的采到ホタル茸，交給オーヴィッド即可完成任務，不過エステル對于他隱瞞任務危險程度的做法相當不滿。
　　 街道燈の交換：和結晶工房的フライディ對話，他說ミルヒ街道上一盞街道燈壞掉了，需要去更換，就是從ロレント市方向算起的第六盞，開啟街道燈的密碼是544818。在ミルヒ街道的第二個場景中可以找到這個壞掉的街道燈，正準備更換的時候一群魔獸出現了，原來是魔獸破壞了街道燈，這里需要選擇對付魔獸和更換街道燈的人選，如果讓エステル去對付魔獸，那么ヨシュア會順利的更換街道燈，如果讓ヨシュア對付魔獸，エステル就會忘記密碼，這時就要看玩家是不是記下來了，更換好街道燈之后返回結晶工房和フライディ對話即可完成任務，同時得到結晶回路“妨害2”。
　　 藥の材料采集：禮拜堂的デバイン教區長為了調配藥物需要一些相關的材料，分別是“ベアズクロー”和“魔獸の羽”，從ロレント市南面出口出城后沿著エリーズ街道前進，在第二個場景中向東進入ミストヴァルト，在最深處寶箱附近的草叢里可以找到“ベアズクロー”，“魔獸の羽”可以通過打倒一些昆蟲系的魔獸得到，收集到這兩樣材料之后和デバイン教區長對話即可完成任務。

　　 兵士訓練：沿著ミルヒ街道一直走可以到達ヴエルテ橋，和房間里的アストン隊長對話，他希望エステル和ヨシュア可以幫助他訓練士兵，實際上就是和他手下的兩名士兵進行戰斗，不管戰斗是否獲勝都可以完成任務，不過為了得到更高的評價還是盡量追求勝利的好。
來到礦山后把市長的介紹信交給礦山入口處的礦工，不過他說礦山長在礦坑里，讓エステル自己下去找。進入礦洞后發現一輛運礦車，先扳動礦車旁的開關，然后上車前進到深入礦坑的電梯前，不過附近沒有開啟電梯的鑰匙，看來要找人問問。乘坐運礦車返回開關處，把開關復原后乘坐運礦車就會找到另一名礦工，說明來意拿到電梯鑰匙，再次返回電梯，終于可以進入礦坑了。在礦坑最深處找到礦山長，得知エステル兩人的任務后礦山長拿出一塊漂亮的七耀石結晶交給エステル，玩性大發的エステル拿著七耀石結晶就在原地轉了起來。突然傳來一聲巨響，礦坑發生了塌方，而且還有大量的魔獸從塌方的位置沖了出來，現在必須盡快的救出所有的礦工。這些礦工分別分布在三個不同的地點，而且エステル還要帶著沒有戰斗能力的礦山長，所以最好迅速解決戰斗，不過礦坑里面有回復裝置，這樣難度就小得多了，救出所有的礦工之后乘坐電梯離開礦坑，還好七耀石結晶沒有被掉在礦坑里，現在可以帶著七耀石結晶返回ロレント市了。

來到市長宅邸，エステル發現這里有一名穿著ジェニス王立學園制服的少女正在和市長交談，看到エステル回來了，市長向他們介紹說這名少女是來自王立學園的ジョゼット，閑聊一陣后エステル把七耀石結晶交給市長，從市長口中大家才知道這是整個ロレント市的市民準備獻給アリシア女王60壽辰的賀禮，隨后市長將七耀石結晶鎖進了保險柜，并且打算過幾天找結晶工房的工匠來打磨一下。
　　 離開市長宅邸后來到游擊士協會報告，受到アイナ夸獎的エステル興奮不已，隨后アイナ宣布了カシウス所接受的最后一個任務，協助リベール通信雜志社的記者進行新聞素材采集，現在記者就住在ロレント市的旅館里。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受兩個分支任務“子貓の搜索”和“エリーズ街道の手配魔獸”。）
　　 子貓の搜索：與酒館西門附近的イーダ對話，得知她的小貓不見了，于是開始搜索這只小麥色小貓的行動。首先可以在計時臺的背后發現這只貓，接著可以在雜貨店的門口看見，一路追到計時臺前，小貓跑進了禮拜堂，最后在禮拜堂的二樓把小貓堵住，不過任憑エステル如何恐嚇發飆小貓都拒絕束手就擒，最后還是靠ヨシュア才能順利的抓住它，再回去和イーダ對話即可完成任務。
　　 エリーズ街道の手配魔獸：出城后沿著エリーズ街道前進，在第二個場景的橋上會發現一只名為“ライノサイダー”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　 進入旅館之后并沒有發現記者的蹤影，和旅館老板對話才知道他們去了酒館，來到酒館總算找到了看起來有點邋遢的記者ナイアル，而且他還很不禮貌的懷疑エステル和ヨシュア的辦事能力，爭執一番之后ナイアル也只能接受這個現實。跟著ナイアル來到結晶工房找到他的攝影師助手ドロシー，一行四人出發前往翡翠之塔，ナイアル的目標是翡翠之塔頂層的古代文明遺跡，要注意在戰斗中ナイアル和ドロシー既不受控制也不會攻擊敵人，而且還要保證他們的安全，實在是一件比較麻煩的事情。
　　 一路殺上翡翠之塔頂層，卻沒想到這里居然已經有人了，他自稱是アルバ教授，也是因為對古代遺跡有興趣才會來到翡翠之塔的，但是上來容易下去難，所以只好在塔頂等著游擊士來救自己下去，恰好就碰上了エステル他們。接下來各人分頭行動，玩家控制エステル和其他角色進行對話，不過ヨシュア的情況似乎不是太好，好象不太舒服似的，與ヨシュア進行第二次對話之后記者也收集到了足夠的素材，終于可以回城里去了。
　　 回到ロレント市，ナイアル、ドロシー還有アルバ教授都各自忙著自己的事情去了，エステル和ヨシュア也該去游擊士協會報告此次的任務情況，在這里又碰上了好久沒見的シェラザード，報告完畢之后大家正在聊天，クラウス市長突然沖了進來，并且說自己家里失竊了，于是三人跟著市長一起來到市長宅邸進行調查。市長的房間被翻得亂七八糟，但是盜賊的目標很明確，就是市長準備獻給女王的七耀石結晶，空空如也的保險柜就是最好的明證。シェラザード讓エステル和ヨシュア在整個宅邸中調查可疑的東西，自己則向市長詢問相關的情報，首先調查有保險柜的房間，包括保險柜、箱子、書架、書桌等等都可以進行調查，然后來到陽臺欄桿邊發現這里有人為造成的傷痕，此外在閣樓上還會發現一張掉落的樹葉，再和市長夫人還有女仆對話，最后下樓去調查玄關，全部調查完畢之后與シェラザード對話并且把自己的判斷告訴市長。這里共有4道選擇題，第一個問題是盜賊的目標，很明顯就是保險柜里的七耀石結晶，因此選第二項；第二個問題是犯人的規模，從市長夫人以及女仆的口中可以得知這批盜賊大概是由3～4人組成的，因此選第二項；第三個問題是盜賊從什么地方進來的，根據陽臺欄桿上的傷痕可以斷定是從二樓的陽臺潛入，因此選第三項；最后一個問題是盜賊可能會是什么人，從盜賊留下的蛛絲馬跡上可以看出應該是近幾天進入過市長的書房，因此選第四項，而可疑的人選就只有雜志社的記者和少女ジョゼット了，而案發時記者正在翡翠之塔，因此ジョゼット就是最大的嫌疑人。
依次向旅館老板和飛行船場的接待員打聽ジョゼット的行蹤，所有的證據都顯示她很有可能就是真正的罪犯，而且在市長家閣樓上找到的樹葉只會生長在ミストヴァルト，于是エステル、ヨシュア和シェラザード三人一起前往ミストヴァルト調查，在ミストヴァルト深處的一條小路盡頭終于找到了ジョゼット，而和她在一起的就是盜賊們，三人上前將他們全部打倒后拿回了七耀石結晶，但正準備抓住他們時一艘飛行船出現救下了ジョゼット，原來是她哥哥趕到了，面對裝備有導力銃的飛行船硬拼當然是不明智的，不過對方也無心戀戰，將ジョゼット救出之后就匆匆飛走了，雖然沒能抓住罪犯，不過七耀石結晶畢竟拿回來了。

　　 回到游擊士協會，アイナ告訴他們為了成為正游擊士，必須得到全國各地的游擊士協會的推薦，當然鑒于兩人在ロレント市的優異表現，現在就能拿到本地區游擊士協會的推薦書了。正當エステル高興的時候通信器響了，アイナ聽完消息臉色大變，原來一艘定期飛行船在ボース區域附近失蹤，乘客和船員全都下落不明，而這恰好就是カシウス乘坐的那一艘飛行船，因此カシウス的名字也出現在了失蹤者的名單上。

第一章　消えだ飛行客船
　　 父親失蹤的消息讓エステル大受打擊，不過生性開朗的她很快振作了起來，她決定前往ボース市，一方面繼續進行準游擊士的修行，一方面調查飛行船失蹤的真相，而シェラザード也表示會和他們一起出發，不過由于飛行船的失蹤事件，各城市之間的飛行船往來已經暫時停止了，因此必須步行前往ボース市。
　　次日三人來到游擊士協會向アイナ說明了自己的打算，通情達理的アイナ自然也不會拒絕，出發前エステル帶著ヨシュア來到了城里的計時臺前，原來十年前リベール王國和エレボニア帝國爆發了百日戰役，當時エステル的母親就是在這里用自己的生命保護了自己的女兒，現在父親也失蹤了，自己一定要振作才可以。
　　 （離開ロレント市之前可以從游擊士協會的揭示板上接受本城的最后一個分支任務“親書の配達”。）
　　親書の配達：デバイン教區長有一封信要交給ボース市的ホルス教區長，幫他把信帶過去即可完成任務。

　　 離開ロレント市沿著ミルヒ街道前進，到達ヴエルテ橋后與隊長對話辦理過關手續，然后穿過關卡就進入了ボース地區的東ボース街道，一直走下去很快就可以到達ボース市了。ボース市游擊士協會的負責人是ルグラン老人，向他說明自己的來意后ルグラン介紹了一些當前的局勢，目前負責調查飛行船失蹤事件的是百日戰爭時的英雄モリガン將軍，而非軍方人員在接受正式委托之前是不允許進行相關調查的，因此ルグラン建議エステル去找ボース市的市長，只要接受了正式的委托事情就好辦多了。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受三個分支任務“山道の魔獸搜索”、“食材の收集”和“東ボース街道の手配魔獸”。）
　　 山道の魔獸搜索：ラヴェンヌ村附近出現了大量的魔獸，而且沒人知道為什么會這樣，因此村長希望游擊士可以解決這一難題。沿著西ボース街道前進，在第二個場景處向北進入岔路就可以到達ラヴェンヌ村，與村長對話后往北面的礦山方向前進，在第二個場景中會發現巨型的魔獸，這就是魔獸大量出現的原因，消滅它之后回去ラヴェンヌ村長對話即可完成任務。
　　 食材の收集：ボース市東北角的酒館里，グルナ正在為練習用的食材不足而發愁，其實她需要的食材很簡單，只不過是5個“魔獸の鳥肉”，按道理說靠打怪現在就應該有足夠多的“魔獸の鳥肉”了，交給她即可完成任務。
　　 東ボース街道の手配魔獸：出城后沿著東ボース街道前進，一直走到第四個場景就會在路邊發現一只名為“キングスコルプ”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　 來到ボース北市區西側的市長宅邸，不過市長執事說現在市長應該在禮拜堂，于是三人又急忙趕往禮拜堂，結果還是沒發現市長的蹤影，只看到市長的女仆リラ，她說市長前往ボース市的中心市場視察去了，大家只好又跑到中心市場去找人。剛走進市場就看到一位年輕的女士正在指責一些黑心商人的行徑，看來這就是我們要找的目標メイベル市長了。
　　 エステル等人跟著メイベル市長來到城里的酒館，交談之后大家得知モリガン將軍和メイベル市長已經去世的父親是好朋友，而市長也希望可以盡快解決飛行船失蹤的事件，于是寫了一封信交給エステル，希望モリガン將軍看過之后可以提供一些相關的情報，最后市長告訴エステル，モリガン將軍的部隊就駐扎在王國北部和帝國接壤的ハークン門。
　　 來到ハークン門之后與衛兵交談，得知將軍目前不在營地中，因此衛兵讓大家先去酒館中休息一下，將軍回來之后就會來通知他們。在酒館里碰上一個自稱是流浪演奏家的金發青年，交談幾句過后衛兵前來通知エステル說將軍回來了。向モリガン將軍說明來意后獲悉定期飛行船是被一伙空賊綁架了，目前這名為カプア一家的空賊團正向王國方面勒索贖金，不過讓大家意想不到的是原來在ロレント市中偷走七耀石結晶的少女正是空賊團三兄妹之一，正當大家還想獲得更多情報的時候エステル一下把自己并不是ボース游擊士協會成員的事情說了出來，將軍不由得大為光火，而エステル也同樣毫不示弱，于是三人就被士兵們轟出了軍營。
　　 在軍營外又看到了那個金發的家伙，這次他居然死皮賴臉要跟著エステル一起行動，眾人拿他沒辦法，只好帶著這個名叫オリピェ的演奏家返回了ボース市，不過回城后オリピェ又離開眾人不知跑到什么地方去了。エステル三人再次來到市長宅邸，在門口意外的發現了ナイアル和ドロシー，他們想采訪メイベル市長，但是被リラ拒之門外了。見到市長后說明了在ハークン門發生的事情經過，于是メイベル市長答應正式把調查空賊團的任務委托給エステル，不過在接下來的閑聊中エステル把父親的姓名說出來時，市長的表情卻顯得十分震驚。離開市長家來到游擊士協會報告，隨后大家決定先去收集空賊團的情報再開始進一步的行動。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受三個分支任務“ペアズクローの調查”、“霧降リ峽谷の手配魔獸”和“西ボース街道の手配魔獸”，此外前往琥珀之塔還可觸發分支任務“琥珀の塔の不審者”。）
　　 ベアズクローの調查：ボース市中心市場的スペンス老人正在尋找一種名為“ベアズクロー”，可以作為食材的植物，還說這種植物都生長在濕氣很重的地區，而附近最符合這個條件的就只有霧降峽谷了。沿著東ボース街道前進到第四個場景，然后往北走就可以進入霧降峽谷，之后有兩條岔路，不論往那條岔路走都可以找到ベアズクロー，拿回去與スペンス老人對話即可完成任務。
　　霧降リ峽谷の手配魔獸：進入霧降峽谷之后選擇往西邊的岔路，在峽谷深處就會發現一只名為　　“マスタークリォン”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 西ボース街道の手配魔獸：出城后沿著西ボース街道前進，走到第二個場景就會發現一只名為“サンダークエイク”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 琥珀の塔の不審者：出城后沿著アンセル新道前進，走到第二個場景后往西邊岔路進入琥珀之塔，在1層會聽到有人說話的聲音，然后一直上到5層就會發現アルバ教授，打倒襲擊教授的魔獸之后帶著教授返回ボース市即可完成任務。

為了獲得更多的空賊團情報，エステル在酒館里找到了ナイアル幫忙，在答應幫助他順利采訪到メイベル市長之后，ナイアル提供了一條很有用的消息，據說在ラヴェンヌ村有人看到過飛行船的蹤影，眾人決定前去打聽更加詳細的情報。
（進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受兩個分支任務“護衛の依賴”和“アンセル新道の手配魔獸”。）
　　 護衛の依賴：ハトル要前往クローネ峠的關所，不過一路上有魔獸出沒，因此他需要游擊士的護送，在旅館1層房間內找到ハトル，他會先去ボース市的西門附近等待，準備好之后就可以去那里找他一同出發。在行進到クローネ山道上的吊橋時會遇上魔獸的襲擊，2場戰斗后消滅魔獸，然后將他護送到クローネ峠的關所即可完成任務。
　　 アンセル新道の手配魔獸：出城后沿著アンセル新道前進，走到第二個場景的盡頭處就會發現一只名為“アンバータートル”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　 在前往ラヴェンヌ村的途中大家碰上了一個背著巨劍的紅發青年，交談中エステル被他取笑了一番，不過聽ヨシュア和シェラザード說這名紅發青年也是一個很有名氣的游擊士，人稱“重劍のアガット”。來到ラヴェンヌ村向村長打聽飛行船的消息，才知道原來是村里小孩ルゥイ看到了飛行船，不過村子里的大人都認為這不過是小孩子做夢罷了。エステル來到村子東南角與ルゥイ對話，他說飛行船是向著北邊廢礦區的方向去了，于是三人又急急忙忙往廢礦區趕去。
　　 來到廢礦區入口才發現大門被上了鎖，為了繼續深入調查一行人只好又返回村子尋找進入廢礦區的方法，在村子的墓地里找到村長，對話之后拿到廢礦區大門的鑰匙。再次來到廢礦區進行調查，果然在廢礦區深處發現了失蹤的定期飛行船，此外還有空賊團三兄妹中的キール和ジヨゼツト兩人以及一幫空賊手下，雖然他們不是エステル等三人的對手，但借助キール的煙霧彈依然駕駛著飛行船逃走了。進入遺留在廢礦區中的定期飛行船調查，三人查看過全部船艙之后來到飛行船三層的甲板討論有關案件的問題，正當大家準備離開飛行船的時候モリガン將軍帶著軍隊趕來，居然將三人以嫌犯的理由加以逮捕，并被帶往ハークン門的監獄中關押了起來。
　　 經過討論，大家都覺得在軍隊中一定有人在給空賊們通風報信，而這也正是軍隊遲遲無法偵破空賊團案件的最大原因，正說話間從隔壁牢房中傳來了大家熟悉的聲音，原來是那個流浪演奏家オリピェ因為吃了價值50萬的霸王餐而被關在這里。次日一早有士兵前來通知大家被無罪釋放了，原來是メイベル市長出面和モリガン將軍進行了交涉，不過將軍似乎也和エステル的父親相識，并且對他選擇成為游擊士相當有意見。在離開軍營的時候大家順便把オリピェ也一起救了出來，因此他再次加入到了エステル的隊伍之中?；氐渐幞ぅ佶胧虚L的家里后聽說前一天在ボース市的南街區上發生了大規模的盜竊事件，很有可能就是空賊團所為，因此大家決定去南街區打聽一下消息。
　　 在結晶工房遇上ナイアル兩人，交談之后來到武器店對面的民宅中向這里的老婆婆詢問有關盜竊事件的情況，但卻遭到了士兵的阻撓，而且在離開這間民宅后還被一隊士兵攔下進行盤查，這時王國軍的リシセール大佐出現替大家化解了這一麻煩，少掉這些礙事的士兵事情就好辦多了，再去和那位老婆婆對話，隨后出現的老爺爺告訴大家最近一段時間在他釣魚的地方經常有人說看到奇怪的東西，看來又有必要前去仔細的調查了。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受分支任務“盜まれた指輪”，此外在空賊老巢中還能觸發分支任務“黑いノート”。）
　　 盜まれた指輪：在發生的這一大規模盜竊事件中，ラーナ的“貴石の指輪”被盜了，在南街區最東面的屋子可以找到ラーナ，而這枚“貴石の指輪”要到本章快結束的時候在空賊團老巢的寶箱里才能找到，屆時帶回來給她即可完成任務。
　　 黑いノート：進入空賊老巢之后可以在某一個房間中發現類似吸塵器的東西，調查之后得到道具黑いノート，本章結束后前往ハークン門軍營的地下監獄，與這里的士兵對話得知他們正在調查一個犯人犯罪的證據，而黑いノート正是士兵在尋找的證據，交給士兵即可完成任務。

　　 沿著アンセル新道來到ヴァレリア湖畔，和旅館里的服務員對話得知經常和ボース市里老爺爺一起釣魚的客人現在正好在湖邊的棧橋上垂釣。來到湖邊向ロイド先生詢問他所見到的情形，原來他在夜里曾經在這附近看到過一男一女的人影，而且其中的女性還穿著學生制服，看起來沒找錯地方?；芈灭^后與老板娘對話，眾人決定在這里等到夜間看是否有所收獲，由于天色尚早，シェラザード拉上オリピェ喝酒去了，エステル想去釣魚，而ヨシュア則找了個地方看書。先到旅館下方的棧橋調查一番，然后向旅館老板娘借到釣竿之后就可以去棧橋上釣魚了，直到黃昏過了一把釣魚癮的エステル才起身尋找ヨシュア，結果只看到座位上放著一本《實錄·百日戰役》，在西南邊的棧橋上找到ヨシュア，閑聊中ヨシュア拿出口琴又吹起了那首熟悉的“星の在り處”，想到從他被カシウス收養到現在已經5年了，不由感嘆時光飛逝如斯?？纯磿r間差不多了，兩人來到旅館吃晚飯，這才發現オリピェ已經被シェラザード灌得爛醉如泥了。吃過晚飯后將オリピェ送回房間休息，其余三人準備開始調查旅館周圍，先來到西南方向的棧橋上查看，然后上旅館2層陽臺正對著街道入口的位置，果然看到了キール和ジヨゼツト這兩個熟悉的身影。三人跟著他們再次來到了湖邊，從偷聽到的對話中得知空賊團的老大，也就是キール和ジヨゼツト的大哥ドルン最近的行為一直有些反常，特別是劫持飛行船勒索贖金這件事，難道說這其中還有什么陰謀嗎？這時一艘小艇從湖面上駛來，艇上一個穿黑衣戴面具的家伙向空賊兄妹透露了相當多的消息，エステル三人商量后決定前往街道方向尋找空賊艇的下落。
　　 很快眾人在琥珀之塔發現了空賊艇，而且醒過來的オリピェ也趕到了，不多時キール和ジヨゼツト兩人回來了，眾空賊駕駛著空賊艇“山貓號”返回空賊老巢，而誰都沒有注意到艇上多了四個人。
　　 空賊艇降落之后一干空賊紛紛回到自己的房間休息去了，エステル等人乘機在這里展開了搜索，注意在空賊老巢中有很多房間，上了鎖的房間會引發劇情，因此可以先開啟所有沒上鎖的房間從寶箱里得到一些裝備和道具。在一個房間里打倒一群空賊嘍羅后眾人找到了定期飛行船上的船員和乘客，可全部的人質只有16人，就是沒有看到カシウス，這時船長告訴エステル曾經有一名乘客在中途就下船了，但是乘客記錄并沒有來得及更新，因此當飛行船被劫持之后對外宣布的消息是共有17名人質，看來父親根本就不在這里。

在告訴船員和乘客安心在此等待之后，エステル和同伴們繼續尋找空賊團的頭目，向前走一點會看到另一個上了鎖的房間，空賊三兄妹正在商量今后的計劃，而且ドルン還聲稱要在拿到贖金之后殺死所有的人質，結果與自己的弟弟妹妹發生了沖突，不過エステル的出現打斷了他們之間的爭吵。打倒空賊三兄妹之后ドルン似乎從夢中醒來一樣，完全不記得自己劫持飛行船的事情了，キール故伎重施使用煙幕彈逃走，不過毫無疑問他們一定是往空賊艇的方向逃跑了，眾人一路追過去，中途還消滅了不少沖出來為三兄妹爭取時間的空賊，結果趕到空賊艇處才發現大量的王國士兵已經把這里團團包圍了，甚至連リベール通信雜志社的記者二人組都趕來了?？召\三兄妹被帶走之后モリガン將軍和リシセール大佐出現，將軍很不滿這些游擊士的出現，但リシセール大佐卻對エステル等人的表現贊賞有加，隨后與部下カノーネ大尉一起去營救被囚禁的人質。
　　 順利完成任務的エステル等人回到了ボース市的游擊士協會，報告完任務之后同時也得到了ボース市游擊士協會的正游擊士推薦書，正當大家為不知下落的カシウス擔心的時候，飛行場的郵遞員送來因為空賊事件而被耽擱的一封信和一個包裹，信是父親寄給エステル和ヨシュア的，他希望兩人可以為成為正游擊士而努力，而那個寄件人不明的包裹居然是寄給カシウス，里面是一塊奇怪的黑色物體，一個署名為K的人希望父親可以把這件物品交給“R博士”去研究，根據オリピェ的判斷這很有可能是古代文明遺留下來的導力器。一方面為了繼續尋找父親的下落，一方面為了獲得正游擊士的資格，エステル和ヨシュア兩人決定繼續前進，將シェラザード和オリピェ送上返回ロレント市的飛行船后，兩人展開了新的旅程，而他們所不知道的是シェラザード已經察覺了オリピェ的真實身份是エレボニア帝國的諜報員，而且エステル的父親カシウス的名字也出現在了他們的對話中，只不過這個名字前加上了諸如“稀世之謀略家”、“劍圣”等很多的頭銜而已，原來他才是オリピェ來到リベール王國的真正目標。 　　第二章　白き花のマドリガル
　　 離開ボース市后沿著西ボース街道和クローネ山道來到クローネ峠的關所，天就要黑了，于是エステル和ヨシュア打算先在這里休息一夜，明天再繼續趕路，與關所內的士兵隊長對話后就可以去隔壁房間休息了，正在吃晚飯的時候又來了一個過夜的游擊士，居然就是那個一向看不起人的重劍のアガット，還是不要去招惹他比較好。當夜關所突然遭到了狼群的襲擊，從ボース地區這邊的大門出去會看到士兵們正在與狼群搏斗，而ルーアン地區那邊的大門外也有狼群出現，エステル兩人急忙沖過去對抗狼群，在アガット的協助下總算是把狼群給消滅了。第二天醒來之后發現アガット已經先出發了，エステル和ヨシュア準備一番之后也告別關所的士兵向ルーアン市前進。
　　 （在去マノリア村之前可以到バレンヌ燈臺觸發分支任務“燈臺の魔獸掃討”。）
　　 燈臺の魔獸掃討：與燈臺門口的フォクト老人對話，得知燈臺里聚集了大量的魔獸，接受任務之后進燈臺消滅每一層的魔獸，然后出來與フォクト老人對話即可完成任務。

　　 沿著マノリア間道來到マノリア村，和旅館的老板對話后得到兩個弁當，老板還建議兩人去村子南邊的展望臺一邊吃弁當一邊看風景，結果エステル出門的時候和一個少女撞在了一起，她還向エステル詢問是否見過一個戴著帽子10歲左右的小男孩，隨后又匆匆的離去了。エステル和ヨシュア來到村子南邊的風車下吃完弁當，在回旅館的路上エステル又撞上了一個小男孩，看他的外貌和那位少女要找的正是同一個人，把這件事告訴小男孩之后他哈哈兩聲也跑開了，ヨシュア很快反應過來，原來剛才的小男孩是個小偷，兩人的游擊士紋章眨眼間就被他給偷走了。與雜貨店外的サティ對話得知那個戴著帽子的男孩很有可能是附近マーシア孤兒院的孩子，于是兩人決定去那里看看。
　　 離開村子后沿著メーヴェ海道走很快就能看見指向孤兒院的路標，果然一進孤兒院就看見了剛才那個小男孩，他正和另外兩個小孩子在說話，隨后エステル就和這個小男孩クラム在孤兒院里展開了追逐戰，クラム一口咬定自己沒有偷游擊士的紋章，エステル只好使用暴力來對付他了，這時在マノリア村見過的少女出現，不過她和ヨシュア一樣束手無策，最后還是孤兒院的テレサ院長出面クラム才不得不把紋章還給了エステル。之后テレサ院長請兩人進屋休息一下，閑談中エステル知道了少女的名字叫做クローゼ，是ジェニス王立學園的學生，休息的時候就會來孤兒院給テレサ院長幫忙，而她身邊那只可愛的白鳥叫ジーク，クローゼ還表示可以帶エステル兩人前往ルーアン市。
　　 離開孤兒院之后沿著メーヴェ海道前進，在接下來的場景中會聽到有人呼救，沖過去從魔獸群里救出呼救的男子吧。來到ルーアン市的游擊士協會，但是協會的負責人不在，一位名叫カルナ的游擊士讓三人過一段時間再來，于是三人開始在ルーアン市里閑逛起來。先去參觀一下“ラングランド大橋”吧，接著來到南街區看看這里的大型倉庫，但是在一個門口エステル被這里的門衛給攔住了，不過エステル并沒打算和他們爭論什么，沒想到當三人準備返回北街區的時候三個和倉庫門衛一樣打扮的家伙過來找茬了，正當ヨシュア想要教訓他們一下的時候ルーアン市的市長秘書ギルバート出現了，隨后ダルモア市長也趕到，加上エステル表露了自己的游擊士身份，那幾個家伙才灰溜溜的跑掉了。
　　 這時再回到游擊士協會就會見到負責人ジャン了，他說因為有一位王族成員即將來到ルーアン市視察，而游擊士協會必須負責街道的警戒，所以顯得有些人手不足，ヨシュア還提起剛才在南街區發生的事情，ジャン告訴他們那些家伙是倉庫團伙“レイヴン”的成員。離開游擊士協會后天色也已經不早了，恰好“ラングランド大橋”也升起來讓船只通過，看完這一情景的エステル才想起應該去旅館找房間休息了。
　　 （之前經過メーヴェ海道的時候會觸發分支任務“メーヴェ海道の手配魔獸”。）
　　 メーヴェ海道の手配魔獸：在前往ルーアン市的途中肯定會遇上名為“ジャバ”的魔獸，消滅它即可完成任務。

來到旅館和老板對話后定下了房間，這時クローゼ也要返回ジェニス王立學園了，臨走前她還邀請エステル和ヨシュア去參加他們學園的學園祭。和クローゼ分手后回到旅館，上二樓進入老板特別優惠提供給他們的豪華套房，兩人剛準備好好享受一下舒適的房間，一個貴族打扮的男子就沖了進來，他自稱是女王的外甥デュナン公爵，并且要求兩人馬上立刻這個房間，雖然エステル和ヨシュア對他的身份表示懷疑，不過在公爵執事フィリップ的勸說下還是把這個房間讓了出來。可是旅館老板說已經沒有房間了，幸好記者ナイアル出現，并且愿意讓エステル兩人和他共用房間，來到地下一層的房間里和ナイアル閑聊一陣后一天就這么過去了，但是誰也不會想到マーシア孤兒院就在這個夜里發生了意外。
　　 第二天エステル和ヨシュア來到游擊士協會，ジャン讓他們去調查一下マーシア孤兒院發生火災的事件，聽到這個消息后的兩人大吃一驚，急忙向孤兒院趕去。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受三個分支任務“倉庫の鍵”、“試作品の搜索”和“アイナ街道の手配魔獸”。）
　　倉庫の鍵：南街區的ハーグ把倉庫的鑰匙弄丟了，他希望游擊士可以幫他找回來，與南街區最西邊碼頭的ハーグ對話得知他昨天喝醉酒后不小心把倉庫鑰匙掉進了海里，可以在酒館前橫著的木板上發現海里有光亮發出來，然后去酒館向老板借釣竿，再到木板上就可以把鑰匙釣起來，還給ハーグ即可完成任務。
　　 試作品の搜索：武器店的カルノー說自己在アイナ街道上遭到了魔獸的襲擊，結果把研制中的導力銃掉了，完成“アイナ街道の手配魔獸”之后就能得到這個導力銃，拿給カルノー即可完成任務。
　　 アイナ街道の手配魔獸：出城后沿著アイナ街道前進，走到第二個場景向西進入紺碧之塔，在塔附近就會發現一只名為“ヘルムキャンサー”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　來到孤兒院后與在場的村民交談得知テレサ院長和孩子們都很安全，目前正在マノリア村的旅館中休息，于是兩人開始調查現場，調查所有的地點并且與兩個村民對話之后，兩人根據發現的線索判斷這應該是有人故意縱火，也就是選擇第二項，此時クローゼ出現并且要求和兩人一起對這件事情進行調查。三人一起來到マノリア村的旅館向テレサ院長詢問當時的情形，院長說曾經看到了一個銀色頭發的年輕人出現，這時ダルモア市長和ギルバート秘書到來，他愿意在孤兒院重建的這段時間里，提供自己在王都附近的別墅給孩子們居住，此外ギルバート還表示レイヴン的成員可能有很大的嫌疑。
　　 離開旅館的時候クラム的同伴說クラム剛才聽到了ギルバート的話，已經跑去找レイヴン團伙的成員了，三人急忙趕回ルーアン市，誰知大橋就在這個時候被拉起，而クラム已經跑到對岸去了，還好在旅館后面有一艘小船，從旅館地下一層出去和小船上的老爺爺對話借到小船，三人立刻向南街區沖去。
　　 上岸后來到之前曾經到過的倉庫，殺進倉庫果然看到了クラム，于是大家也上前和レイヴン的成員交起手來，當這些家伙被打倒之后一個エステル熟悉的身影出現了，居然是アガット，他教訓レイヴン團伙的手段簡直讓エステル等人自愧不如啊。隨后テレサ院長趕來帶走了クラム，エステル也可以去游擊士協會報告了，クローゼ再次邀請大家去參加學園祭，現在エステル和ヨシュア總算有時間和她一起前往ジェニス王立學園參觀一番。
　?。ㄇ巴弗Д衰雇趿W園之前可以從游擊士協會的揭示板上接受五個分支任務“整備用カハンの搬運”、“古地圖の調查”、“探索の護衛”、“燭臺盜難事件”和“旅行者の說得”。）
　　 整備用カハンの搬運：バレンヌ燈臺定期檢查的時間到了，因此結晶工房的ソームズ希望游擊士能夠將所需的整備用カハン運送過去，與ソームズ對話后前往バレンヌ燈臺和フォクト老人對話即可完成任務，此外如果和酒館老板對話，還可以幫他帶一份アゼリア·ロゼ給フォクト老人。
　　 古地圖の調查：禮拜堂里的ジミー聲稱メーヴェ海道上有海盜的寶藏，來到禮拜堂和他對話，他說這個地點就在メーヴェ海道靠近東南角的沙灘上。從ルーアン市進入メーヴェ海道的第一個場景中沿著海岸線一直往南走，在盡頭的沙灘上會發現一個木桶，調查木桶可以得到一份古地圖以及一把短劍，帶回去與ジミー對話即可完成任務。
　　 探索の護衛：マノリア村的アメリア說自己的叔叔要去クローネ山道，希望有游擊士可以進行護衛工作，趕到マノリア村與村子北邊房屋前的アメリア對話才知道她叔叔已經單獨跑到クローネ山道上去了，進入クローネ山道的第三個場景會找到アメリア的叔叔，這時大家才發現原來他就是分支任務“キノコ狩リ”的委托人オーヴィッド先生，真是人生何處不相逢啊，帶著他返回マノリア村即可完成任務。
　　燭臺盜難事件：ダルモア市長家的祖傳家寶“蒼耀の燈火”被盜了，ギルバート秘書急于尋求幫助。來到市長宅邸和ギルバート對話，然后調查犯罪現場發現了盜賊留下的卡片，根據卡片上的線索依次調查北街區的燈臺、酒館二樓的輪盤賭桌、飛行船場下的電動車、南街區碼頭上的起重機，然后與分支任務“倉庫の鍵”中的ハーグ交談得到倉庫鑰匙，打開倉庫后就能找到被盜的“蒼耀の燈火”，即可完成任務。
　　旅行者の說得：エア＝レッテン關所來了一個十分討厭的旅行者，鬧得其他的旅行者都不得安寧，因此關所的ハーン隊長希望有人能夠盡快解決這個問題。沿著アイナ街道走到盡頭就可以到達エア＝レッテン關所，不過大家都沒想到這個討厭的旅行者就是デュナン公爵，而エステル就需要去說服他讓他離開這里，進入食堂之后開始和デュナン公爵進行交涉，如果不想用暴力驅趕公爵的話，那就按照2-1-1-2的順序來選擇對話，當然不按此順序エステル同樣會揮舞著棍子嚇唬公爵，反正把他弄走即可完成任務。

進入ジェニス王立學園之后三人先來到本館拜訪學園長，隨后又來到食堂二樓的生徒會室，在學生會長ジル的強烈要求之下，エステル和ヨシュア同意參加學園祭中的話劇表演，劇名就是《白き花のマドリガル》。不過這次表演的最大特色就是男女反串，也就是說エステル和クローゼ會扮演騎士，而ヨシュア將扮演美麗的公主，于是在學園祭開始之前，エステル和ヨシュア就留在學園中一直進行著話劇的排練，很快學園祭舉行的日子就要到了，在學園祭的前一天，話劇的排練已經結束，與學園長對話之后，エステル來到食堂和ヨシュア等人交談，之后便可以回寢室休息了。
　　 （前往食堂之前可以在ジェニス王立學園內觸發三個分支任務“舊校舍魔獸退治”、“研究資料の收集”和“校庭の飾リ付け”）
　　 舊校舍魔獸退治：從學園東邊出口來到舊校舍，會看到從里面慌慌張張跑出來一個學生，并且說里面有魔獸，進入舊校舍打倒4組敵人即可完成任務。
　　 研究資料の收集：與食堂2層資料室中的ロジック老師對話，得知他正在尋找《ルーアン經濟史》這一資料，該資料共有三冊，分別前往資料室旁邊的男子更衣室、本館1層的職員室以及男生寢室1層右下房間桌上調查可以拿到，之后拿回來交給ロジック老師即可完成任務。
　　 校庭の飾リ付け：和本館門外的用務員パークス對話，得知裝飾學園的彩帶條幅還沒有全部弄好，不過他一時發現不了還有哪里被遺漏了，因此請エステル在整個學園中看看，如果發現有這種情況就來通知他。調查男生寢室大門、講堂大門右側和本館的東側連接食堂的走廊即可完成任務。

　　 盛大的學園祭終于開始了，由于話劇的演出被安排在下午，因此エステル可以有半天的時間在學園中參觀，在食堂里會看到アルバ教授，同他對話兩次后選擇第二項，把他帶到本館中社會科教室去。下樓后看到了マーシア孤兒院的院長和孩子們也來參加學園祭了，于是ヨシュア帶著孩子們去看會在演出中使用的華麗服裝。當エステル和クローゼ來到舞臺后臺時卻只看到了孩子們，聽他們說ヨシュア追著一個銀發的男子出去了，在白鳥ジーク的指引下兩人來到了學園的舊校舍里。上到舊校舍的二層后看到了ヨシュア，不過并沒看到那個銀發男子，和ヨシュア對話之后聽到學園中召集話劇演員的廣播，排練多時的《白き花のマドリガル》終于可以展示給大家了。
　　 整個話劇的表演非常成功，而且學園祭活動募集到了相當一大筆資金，學園長把這些資金贈送給テレサ院長作為孤兒院的重建費用，并且安排游擊士カルナ將院長護送回マノリア村。エステル和ヨシュア也準備離開ジェニス王立學園了，クローゼ將兩人送到メーヴェ海道上，就在他們準備分手的時候一個村民匆匆趕來，說テレサ院長一行在半路上遭到了襲擊，三人趕緊前往マノリア村查看情況。
　　 （前往マノリア村的途中會觸發分支任務“メーヴェ海道の手配魔獸2”。）
　　 メーヴェ海道の手配魔獸2：在前往マノリア村的途中肯定會再次遇上名為“ジャバ”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 來到マノリア村旅館二樓，和孩子們交談過后アガット也趕來了，眾人決定設法找出犯人的蹤影，大家跟隨著白鳥ジーク來到了バレンヌ燈臺，在這里居然看到了レイヴン團伙的成員，而且看他們的樣子似乎被什么人控制了，一路將這些家伙打倒后沖上燈臺頂層，看到的竟然會是ギルバート秘書和兩名黑色裝束的男子，原來所有的這一切都是ダルモア市長為了奪取孤兒院和燈臺附近的土地而制定的計劃。戰斗后那兩名黑色裝束的男子居然以燈臺老爺爺和ギルバート秘書為人質逃走了，アガット孤身一人趕了上去，エステル他們則留下來進行善后處理。
　　 將ギルバート秘書和レイヴン團伙的不良青年都押回マノリア村之后，エステル回到ルーアン市的游擊士協會進行報告，然后三人一起來到市長宅邸要揭穿ダルモア市長的真面目。來到市長宅邸的二樓見到正在和デュナン公爵交談的ダルモア市長，當大家把事情的真相揭露出來的時候市長居然放出在家中偷偷飼養的魔獸來攻擊エステル。消滅魔獸之后ダルモア市長拿出一根古代文明遺留下來的魔杖，用魔法將三人定身，關鍵時刻エステル身上的黑色導力器突然發出光破解了市長的魔法，見勢不妙的ダルモア市長立刻從密道溜走駕船逃上了海面。雖然大家也駕船追了上去，不過ダルモア市長的船要快那么一點點，眼看他就要順利逃脫，女王直屬親衛隊的飛空艇從天而降將他捉拿歸案。
　　 返回游擊士協會后負責人ジャン說“R博士”很有可能是有工房都市之稱的ツアイス中的某位科學家，于是エステル和ヨシュア決定向著ツアイス市前進，臨行前也得到了ルーアン市游擊士協會的正游擊士推薦書。此時追蹤著兩個黑衣人的アガット也遭遇了戴著面具的黑衣人隊長，他還使用分身之術在戰斗中順利脫身，究竟他會是什么人呢？

　第三章　黑のオーブメント
　　 クローゼ將エステル兩人送到了エア＝レッテン關所，向士兵辦理完畢通行手續后，三人來到關所二層的大壩上依依話別。告別了クローゼ，エステル和ヨシュア進入了通向ツアイス市的必經之路——カルデア隧道，前進到第三場景時一名少女匆匆從ツアイス方向跑來，對話之后得知她要去修理隧道中發生故障的街道燈，想到一個女孩子孤身一人在隧道里實在是太危險了，于是兩人轉身也追了過去。果然沒過多久就看到那個女孩子招惹到了一群魔獸，趕快上去幫忙吧，消滅這些魔獸之后和少女閑談起來，原來她是ツアイス市中央工房的職員ティータ。三人一起穿過カルデア隧道之后到達ツアイス市的中央工房的地下一層，乘坐電梯進入中央工房大廳，和ティータ分手后兩人前往游擊士協會辦理相關的手續。
　　 ツアイス市游擊士協會的負責人是キリカ，她對于エステル兩人的來意也十分清楚，于是把他們一封給中央工房工房長的介紹信交給了他們，現在就可以去拜訪工房長了。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受兩個分支任務“臨時司書求む”和“トラット平原道の手配魔獸”，并且完成“臨時司書求む”后還可觸發三個分支任務“臨時司書の殘業”、“續·臨時司書の殘業”和“續續·臨時司書の殘業”。）
　　 臨時司書求む：中央工房2層資料室的コンスタンツェ希望有游擊士幫助他找回沒有歸還的書，找到她對話后前往中央工房3層的設計室、4層的實驗室和醫務室拿回三本書交給她即可完成任務。
　　 トラット平原道の手配魔獸：出城后沿著トラット平原道前進，在第二個場景中間部分會發現一只名為“クロノサイダー”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 臨時司書の殘業：コンスタンツェ還要尋找一本名為《エルベキツツキの生態》的書，根據她提供的情報，來到ツアイス市往南走的溫泉村ェルモ，在旅館后面走廊下方的石像上可以找到，帶回去即可完成任務。
　　 續·臨時司書の殘業：コンスタンツェ還要尋找一本名為《ハーツ少年の冒險·下》的書，根據她提供的情報，來到接近紅蓮之塔入口的地點，然后從東邊的路口進入一個封閉的場景中，在中間的石頭上可以找到這本書，帶回去即可完成任務。
　　 續續·臨時司書の殘業：現在是コンスタンツェ要找的最后一本書了，書名是《31本の絲杉》，出城后沿著リッター街道一直走到セントハイム門，然后來到三樓調查正對著樓梯的木桶之后可以找到，帶回去即可完成任務。

　　 來到中央工房之后和大廳里的接待員對話，然后上2樓見到マードック工房長，說明來意之后得知所謂的“R博士”指的就是中央工房的天才導力學者ラッセル博士，接著工房長還把ラッセル博士的孫女介紹給大家，原來她就是之前在隧道里見過的少女ティータ。跟著ティータ一起來到ツアイス市區西南角的家里，ラッセル博士正在樓上埋頭于自己的研究，不過在看到奇怪的黑色導力器之后興趣馬上就轉移過來了，并且立刻就開始了對這個導力器的分析，誰知道就在進行研究時導力器再次發出了奇怪的光，并且使整個城市的導力停止而導致全城一片黑暗。
　　 次日在游擊士協會報告導力停止現象后前往中央工房，聽マードック工房長說博士正在3層的工作室里，于是エステル又來到3層找ラッセル博士，因為黑色導力器會導致導力停止，因此博士正試圖用非導力的內燃機關來切開它的外殼進行研究，但是博士卻忘記了哪里才有內燃機關，最后還是ティータ提醒大家可以去5層的演算室查看導力演算器。來到演算室后調查演算器，查看“關聯情報檢索”中的所有選項，現在終于知道內燃機關的保管者是飛行船場的グスタン整備長了，來到飛行船場與售票員對話，恰好看到中央工房的飛行船回來了，兩人向グスタン整備長說明來意后很快就拿到了內燃機關。不過要啟動內燃機關還需要ガンリン作為燃料，和中央工房地下一層生產工場里的工作人員對話后就能拿到一箱ガソリンタンク燃料，然后回到3層的工作室把內燃機關和燃料都交給博士，博士馬上就開始了切割導力器的工作。本來エステル等都對這個奇怪的導力器大感興趣，但工房長這個時候卻跑來說溫泉村ェルモ的機器出了問題，需要馬上去修理，因此エステル和ヨシュア只好保護著ティータ一同前往溫泉村。
　　 （進行此任務前可以從游擊士協會的揭示板上接受五個分支任務“新制品のテスト”、“運搬車の搜索”、“新食材の調達”、“禁煙強化周問”和“リッター街道の手配魔獸”，此外完成“搬運車の搜索”后可觸發分支任務“運搬車の修理”，前往ヴオルフ砦還可觸發分支任務“復活愛の使者”。）
新制品のテスト：中央工房4層實驗室的ティエリ研制了一雙被命名為ストレガ—α的靴子，為了試驗這雙靴子的耐磨能力，需要找實驗者，和ティエリ對話之后得到這雙靴子，只要讓エステル裝備這雙靴子去過ヴオルフ砦、セントハイム門、溫泉村ェルモ以及レイストン要塞，回來和ティエリ即可完成任務。
　　 運搬車の搜索：一輛往ヴオルフ砦方向行駛的運搬車遲遲沒有抵達，游擊士協會要求游擊士盡快前往トラット平原道搜索這輛失蹤的運搬車，出城后在トラット平原道的第二個場景西南方向可以發現這輛運搬車，消滅出現的魔獸后得知車輛發生了故障，駕駛員讓エステル回到中央工房找3層設計室的プロメテ幫忙，回城即可完成任務。
　　 新食材の調達：酒館里的ベン要研究新的料理，因此需要新的食材，到中央工房4層實驗室的溫室內進行調查可以得到“にがトマト”，拿給ベン即可完成任務。
　　 禁煙強化周問：中央工房4層醫務室的ミリアム說有人從醫務室里偷走了煙草，唯一的目擊者是醫務室的小貓アントワーヌ，拿新鮮ミルク給小貓就可以讓它跟著エステル一起行動，ミリアム認為最有可疑的是演算室的トランス主任和1層的フーゴ先生，不過小貓アントワーヌ對他們都沒反應，最后在工房長的房間調查時小貓終于有反應了，找到工房長房間暗室的鑰匙后開門就能找到煙草，回去和ミリアム對話即可完成任務。
　　 リッター街道の手配魔獸：出城后沿著リッター街道前進，在第二個場景岔路附近會發現名為“メルクリバイパー”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 運搬車の修理：找到プロメテ對話，然后前往5樓的演算室，查看演算器中關于運搬車的情報，然后進入地下工場與ルーディ對話得到驅動用部件，再返回發生故障的運搬車處把驅動用部件交給駕駛員即可完成任務。
　　 復活愛の使者：與ヴオルフ砦外站崗的士兵ブラム對話，然后把ブラム的信交給中央工房地下工場中的女工フェイ即可完成任務。如果買了雜貨店的もこもこニット帽或者是武器店的作業服和信一起交給フェイ，任務完成后的評價會提高。 來到溫泉村后與旅館老板對話拿到機器房間的鑰匙，這個房間就在村子的東北角，在ティータ維修機器的時候エステル回到旅館休息，結果聽到店員說有個女客人一個人跑到危險的草原上去了，兩人只好出村找這個不知死活的女人，結果和大家想得一樣，她就是記者ナイアル的攝影師助手ドロシー。從魔獸口里救出ドロシー后返回溫泉村，然后和ティータ一起向旅館老板報告修理結果，在旅館老板的熱情挽留大家決定在這里休息一夜，于是晚上可以好好泡一下溫泉了。
　　 次日三人啟程返回ツアイス市，中途有一個身材如同熊一般的東方男子向他們問路，回到城里發現中央工房方向一片騷動，原來是工房大樓發生了火災，而且ラッセル博士還留在工作室里沒能出來。由于電梯已經無法使用，三人趕快從緊急樓梯沖上三樓，但是工作室并沒有博士的身影，那個黑色的導力器也失蹤了，這時アガット出現和大家一起開始調查，整個火災的場面很明顯是有人故意造成的，眾人來到5層的樓道中發現三名黑衣人正帶著博士從電梯逃走，但是當大家從樓梯下來并向工房外的眾人詢問此事時，得到的答案居然是幾個穿著軍服的士兵剛剛從這里離開，エステル等人雖然迅速對周圍地區進行了搜索，可是依然找不到ラッセル博士的蹤影。
　　 為了獲得綁架博士的犯人資料，眾人來到游擊士協會打聽情報，在這里會看到 アルバ教授，他說看到過這樣的一行人往紅蓮之塔的方向去了，因為此行太過于危險，ヨシュア和アガット勸說ティータ留了下來，隨后三人向紅蓮之塔趕去。來到紅蓮之塔頂層，果然看到了那三個黑衣人，雖然眾人上前打倒了他們，但這些家伙會以博士為人質而準備逃走，這時擔心爺爺的ティータ趕來，結果アガット為了保護她而受傷，同時黑衣人也乘機逃走了。
　　 無法可施之下眾人只好返回ツアイス市再做打算，中途又碰上了那個熊一般的男子，互作介紹之后大家得知他名叫ジン，也是一個游擊士，突然アガット傷勢發作倒在地上，檢查之后才發現原來黑衣人的攻擊導致他中毒了，在ジン的幫助下大家迅速返回市區并且把アガット送到了中央工房里的醫務室。醫務室的醫生說アガット中的是一種特殊的毒素，因此普通的解毒藥是毫無作用的，不過她建議エステル去找禮拜堂的ビクセン教區長。
　　 與教區長對話后得知要配置解毒藥需要一種名為ゼムリア苔的原料，這種植物生長在カルデア隧道附近的鐘乳洞里，眾人來到游擊士協會向負責人キリカ詢問有關這種植物的詳細情報，而ジン也同意和他們三人一起前往鐘乳洞中的洞窟湖。
　　 洞窟湖在鐘乳洞中的西北方向，調查洞窟湖邊的大石頭就可以得到ゼムリア苔，正當大家準備離開這里的時候從湖水里出現了魔獸，齊心協力消滅魔獸后盡快返回ツアイス市吧，把得到的ゼムリア苔交給教區長就能得到解毒藥了，有了這個解毒藥アガット總算脫離了危險。
　　 第二天大家來到飛行船場送ジン離開，正巧碰上了ドロシー，她拍攝的照片中有一張引起了大家的注意，在這張セントハイム要塞的照片中居然有黑衣人那艘飛空艇的影子，エステル和ヨシュア立刻動身前往セントハイム要塞進行調查，但卻被要塞的守備隊長シード少佐攔住了，不過要塞大門關閉時出現的導力停止現象更讓他們確定博士一定就在這里。
　　 （前往セントハイム要塞前可以游擊士協會的揭示板上接受分支任務“リッター街道の手配魔獸2”。）
　　 リッター街道の手配魔獸2：沿著リッター街道向セントハイム要塞前進，在中途會發現一只名為“ブラディセイバー”的魔獸，消滅它即可完成任務。

　　 返回游擊士協會之后眾人商議決定利用中央工房的飛行船潛入セントハイム要塞，不過要塞方面會用生體感知器來查看是否有生物潛入，要順利通過這一檢測就必須拿到博士研制出的妨害器，在博士家中的二樓可以找到這個妨害器，然后在游擊士協會拿到セントハイム要塞的概略圖，全部準備就緒之后エステル、ヨシュア、ティータ以及傷愈的アガット登上中央工房的飛行船向要塞出發了。
　　 在飛行船上和所有人物對話一番之后就要到達目的地了，グスタン整備長讓四人躲進一個貨柜箱里，飛行船降落之后士兵開始用感知器進行檢測，結果只發現了藏在一個貨柜箱里的小貓アントワーヌ，エステル等算是順利的通過了這一關。士兵們離開后大家開始了營救行動，按地圖前進來到中央研究室，然后為了避開放哨士兵的注意貼著下方的墻壁前進到研究室側面的窗戶處，隔著窗戶大家看到的居然是リシセール大佐和黑衣人隊長ロランス少尉，原來幕后的黑手就是他們。這兩人離開之后大家沖過去打倒放哨的士兵救出了博士，但是在逃走的時候卻被發現了蹤跡，避開巡邏士兵后進入司令部尋找出路，沒想到在地下的牢房里看見了久違的空賊三兄妹。
　　 一行人在司令部里沒能找到出路，于是決定沖出司令部再想辦法，這時傳來一個神秘的聲音指引大家來到一個房間，可救出大家的居然就是要塞守備隊長シード少佐，對話中大家發現王國軍內部有著相當腐敗的現象，之后シード少佐安排大家從暗門進入下水道逃生。逃出生天的眾人決定分頭行動，アガット會保護著ラッセル博士以及ティータ暗中逃亡，而エステル和ヨシュア要盡快趕往王都グランセル，雙方約定將在王都匯合，告別アガット等人后エステル兩人向著目的地繼續進發，但就在他們出發之時王都方面也發生了意外，由于リシセール大佐的陰謀，女王直屬親衛隊被判處叛國罪，クローゼ雖然有親衛隊中隊長ユリア中尉的拼死保護，但還是落在了リシセール大佐的手中。

終章　王都撩亂
　　 回到ツアイス市的游擊士協會，キリカ告訴他們前往王都的定期飛行船將在11點起飛，當然也把ツアイス市游擊士協會的正游擊士推薦書交給了他們，于是兩人來到飛行船場準備盡快趕到王都去。和售票員對話后得到兩張飛行船票，但在登船的地方卻發現因為之前發生的空賊團事件，軍方對于乘坐飛行船的旅客都會進行嚴格的檢查，為了躲過リシセール大佐的耳目，兩人還是決定步行前往王都グランセル。來到セントハイム門時還是碰上了士兵的盤查，幸好アルバ教授出面給他們解了圍，兩人順便護送教授平安到達了グランセル。
　　 來到グランセル市的游擊士協會向負責人エルナン辦理相關的手續，但是想要見到女王肯定不是一件容易的事情，于是兩人先來到北街區的グランセル王城打聽消息。和守門士兵對話之后得知只能在女王誕辰那天才有機會和女王見面，而且兩人還發現デュナン公爵現在居然是女王的代理身份。聽說公爵要去參觀武術大會，エステル和ヨシュア也跟著來到了東街區的王立競技場。
　　 在旁邊的售票窗口買票之后進入競技場，然后來到2層的觀眾席觀看比賽，第一場獲勝的是四個游擊士組成的隊伍，第二場則是兩人認識的壯男ジン一人干掉了他的對手。比賽結束后來到1層左側的休息室，獲勝的游擊士小隊說比武大會的最終獲勝者會被邀請進入王城，因此兩人決定和ジン組成一隊參加比賽。
　　 回到游擊士協會和エルナン對話之后她建議兩人去附近的酒館以及共和國大使館找找看，結果在酒館里沒有遇到ジン，倒是碰上好久不見的オリピェ，結果原本應該很高興的會面場景以オリピェ被エステル暴打而告終。接著來到東街區的共和國大使館，門衛告訴他們ジン可能去エルベ周游道附近修行去了，于是兩人趕緊往エルベ周游道跑去。來到エルベ周游道東南方向的岔路盡頭會碰上一名被魔獸襲擊的修女シスター，消滅了第一批魔獸之后又會有一群魔獸出現，這時ジン出現加入兩人的隊伍，消滅第二批魔獸后兩名情報部的特務兵趕來，在眾人表露身份之后護送著シスター修女離開了。
　　 三人一同回到城里的酒館商量參加武術大會的事宜，不過第四個人選讓他們大傷腦筋，這時オリピェ又跳出來了，于是所有的人員也就這么確定了下來。休息一夜后四人在旅館會合進行比賽前的準備工作，武器、道具之類都準備好就可以前往競技場了。在1層右側的房間休息時和所有人物對話，隨后比賽就會正式開始，游擊士小隊首先贏得了第一場比賽，エステル四人的對手則是ルーアン市的不良團伙レイヴン，打敗他們之后輪到其他的隊伍進行比賽，勝出的分別是空賊三兄妹的空賊隊以及由ロランス少尉率領的特務兵小隊。今天的比賽已經全部結束了，在離開競技場的時候レイヴン團伙的成員交給大家一枚王都地下水道的入口鑰匙，這樣就可以去下水道里挑戰更厲害的魔獸。
　　 在游擊士協會報告后來到旅館，記者ナイアル已經在這里等候多時了，而ヨシュア也想請他幫忙調查一下リシセール大佐、カノーネ大尉以及ロランス少尉的資料。第二天還要繼續進行武術大會，今天的對手是游擊士小隊，打敗他們之后就輪到空賊隊和特務兵隊比賽了，結果當然是毫無懸念的由特務兵勝出。比賽結束后來到西街區的リベール通信雜志社找ナイアル拿到他調查得到的情報，然后去游擊士協會報告，可以拿到另一把地下水道的鑰匙。返回旅館后兩人發現自己的房間里有人進來過，并且留下了一張字條，讓兩人天黑后去西街區的大圣堂見面。
（前往地下水道的東區和西區可以觸發分支任務“地下水路東區畫の手配魔獸”和“地下水路西區畫の手配魔獸”。）
　　 地下水路東區畫の手配魔獸：在地下水路東區可以發現名為“ボーンフィツシュ”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 地下水路西區畫の手配魔獸：在地下水路西區可以發現名為“シザーハンズ”的魔獸，消滅它即可完成任務。
　　 夜里王都內有不少士兵在巡邏，前往大圣堂比較穩妥的方法是通過南街區再到西街區，來到大圣堂之后發現在此等候的就是之前在エルベ周游道救出的修女シスター，而她居然是ユリア中尉假扮的，她把一封寫給王城女官長的信交給兩人，希望兩人能夠成為武術大會的優勝者，并且以此身份參加王城里的晚宴，伺機和女王進行接觸。
　　休息一夜之后來到競技場，經過一場苦戰之后終于打敗了特務兵隊，也拿到了デュナン公爵頒發的晚宴招待狀，不過可憐的オリピェ剛走出競技場就被從帝國來的同伴拉走了無緣晚宴，余下的三人則一起來到了王城中。在晚宴開始前的自由活動時間里，エステル和ヨシュア來到王城頂部的空中庭院，并且順利的見到了女官長ビルダ夫人，看到ユリア中尉的信后ビルダ夫人讓兩人在晚宴結束后去王城一層的女仆房間見她。
　　 晚宴準時開始了，リシセール大佐竟然在晚宴上宣布女王即將把王位傳給デュナン公爵，這個消息讓大家都吃驚不小。好不容易捱到晚宴結束，エステル兩人急急忙忙前去和ビルダ夫人見面，半路卻被リシセール大佐拉去閑聊，還提到不少有關父親的往事。從リシセール大佐處脫身后盡快來到一層的房間，為了見到女王エステル化裝成女仆的樣子，ヨシュア也不得不再次男扮女裝。
　　 在ビルダ夫人的帶領之下進入女王宮，然后把之前所發生的事情一一向女王匯報，從女王的口中兩人才知道原來リシセール大佐的真正目的是王城地下的古代遺跡，最后女王拜托兩人將落入敵人手中的クローディア公主救出來。告辭女王之后兩人返回王城的房間準備休息，卻遭到了カノーネ大尉的盤問，還好及時出現的ジン替兩人遮掩過去了。
　　 次日來到游擊士協會和エルナン商量如何解救公主，根據目前掌握的情報，公主被關在エルベ離宮的可能性最大，不過僅僅依靠幾個人的力量肯定是不夠的，因此エルナン讓エステル去找武術大會上的游擊士小隊，并且和ユリア中尉取得聯系。在東街區中心市場、南街區武器店、南街區酒館和北街區旅館可以找到游擊士小隊中的四名成員，不過大圣堂的司教說中尉已經離開了?；氐接螕羰繀f會，正在大家制定營救計劃的時候ユリア中尉出現了，她說已經聯系到了隱藏在王都各處的親衛隊隊員，眾人詳細安排了營救行動的計劃之后向著エルベ離宮前進。

沖進離宮后把房間內的敵人全部打倒，與其中一個房間內的執事對話得知大門鑰匙隱藏在展示室里，調查展示室房間中的大壺得到鑰匙后開啟大門，在這里大家發現了被抓的クローゼ和記者ナイアル，原來クローゼ就是女王的孫女クローディア公主。這時守衛離宮的特務兵中隊長帶著部下跑了出來，還挾持了モリガン將軍的孫子，不過他們身后突然出現了シェラザード和オリピェ，三下兩下就把這幫敵人給解決掉了。
　　 脫險之后クローゼ請求大家設法救出女王，這種請求當然不能拒絕，于是全體隊員分為兩只隊伍分頭行動，ヨシュア、オリピェ和ジン將借助クローゼ提供的王都地下水道地圖尋找地下水道中的暗門潛入王城，エステル、シェラザード和クローゼ則會乘坐搶到手的飛空艇從空中突擊王城，準備就緒之后兩邊人馬都開始了行動。
　　根據地圖的指引可以找到地下水道中暗門的位置，隨后ヨシュア三人便可以潛入王城，然后從東南角的樓梯上去打倒房間里的士兵就行了。接著輪到エステル一方，飛空艇降落之后會遭遇カノーネ大尉，將其打倒后繼續前進，又碰上了デュナン公爵，當然這個家伙比カノーネ大尉更差勁。不過當三人進入女王宮后發現ロランス少尉正等在這里，拿掉面具大家才發現原來他就是那個銀發男子。和ロランス少尉的戰斗會相當辛苦，不過這里失敗也沒有關系，戰斗結束后ロランス少尉便會從陽臺跳下離開，不過他為リシセール大佐拖延時間的目的已經達到了。
　　 眾人會合之后在女王的帶領下來到王城地下通往古代遺跡“封印區畫”的大門處，這時アガット、ティータ和ラッセル博士也趕來了，選擇同行的隊員之后進入封印區畫，之后還可以在博士這里更換隊員。一路前進到封印區畫3層的中央區域，大家又看到了陰魂不散カノーネ大尉，再次將其打倒吧。
　　 最終的決戰將在封印區畫的最下層，也就是第五層展開，眾人在這里發現了正要開啟古文明七至寶之一“輝之環”的リシセール大佐，而他要開啟“輝之環”的原因是想讓王國不會再受到侵略的威脅，但是當ヨシュア質問他怎么知道這個地下遺跡時他居然完全沒有印象，看來他也是被人利用，而且記憶上也出現了問題。當大家上前將リシセール大佐擊倒之后“輝之環”居然自行啟動了，而守護這一遺跡的“環之守護者”也出現在眾人面前，這一戰斗中要注意當“環之守護者”蓄力準備攻擊一條直線上的敵人時一定要躲開，否則會遭受沉重的打擊。經過一場苦戰之后“環之守護者”被打倒，但它居然組合成為了另一種形態，不但擁有高達20000的HP，而且還有極為強力的攻擊技能，因此在這一最終決戰中一定要隨時注意回復，然后逐步消耗守護者的HP直到勝利。
　　 打倒“環之守護者”后眾人都已經累得氣喘吁吁了，沒想到“環之守護者”還有戰斗的能力，ヨシュア拼起最后的力量擋在エステル身前，不過出人意料的是リシセール大佐出手和守護者斗在一起，并且讓エステル等人盡快逃走，雖然リシセール大佐的劍術不凡，但他使用的武器很快就被守護者打斷了，眼看他就要喪命于此，一個熟悉的聲音傳來，而后一條人影閃過廢掉了守護者的右臂，原來是カシウス及時趕到，接下來エステル等人還要和“環之守護者”再打一場，不過此時的守護者只有5000點HP，而我方四人的CP全滿，因此很輕松就能獲勝了，之后其余的同伴紛紛趕到，而カシウス在教導リシセール大佐一番之后也表示將重新返回王國軍隊中。
王都的動亂終于結束了，一周之后アリシア女王的生誕祭也如期舉行，完成一系列任務的エステル和ヨシュア也拿到了グランセル市游擊士協會的正游擊士推薦書，如此5個地區的正游擊士推薦書都得到了，因此兩人也獲得了正游擊士的稱號。
　　 （此時先去王城中的酒吧和オリピェ對話，然后可以在游擊士協會的揭示板上接受最后一個分支任務“帝國大使館の依賴”。）
　　 帝國大使館の依賴：帝國大使館的武官ミュラー正在尋找一個金發白衣，自稱是演奏家的人，這個人怎么看都是オリピェ，再次來到王城2樓的酒吧和オリピェ對話，然后帶著他來到游擊士協會，當ミュラー趕來帶走オリピェ后即可完成任務。

　　 兩人在王都大街上散步，來到東街區中心市場附近的休憩所時ヨシュア提議坐下來休息一下，閑談一陣之后エステル跑去買冰淇淋，這時アルバ教授出現了，ヨシュア對他的真實身份提出了懷疑，原來在翡翠之塔和他第一次見面時ヨシュア就覺得有一種很不好的感覺，但ヨシュア沒想到的是自己的記憶也被這個人更改了，隨著アルバ教授一聲響指，ヨシュア所有的記憶都回來了，他也認出這個自稱アルバ教授的其實是“蛇之使徒”那7人中的“白面”ワイスマン，而ヨシュア本身的真實身份是綽號“漆黑之牙”的“執行者”13號。王國發生的所有事件幾乎都是在ワイスマン的暗中擺布下發生的，他聲稱這一切只不過計劃中的第一階段，而且在過去的5年中，ヨシュア還因為ワイスマン的暗示，把有關カシウス的資料都報告給了他，但是這一切ヨシュア根本就沒有任何的記憶。
　　 ワイスマン走后不久エステル就拿著冰淇淋回來了，ヨシュア還要裝出什么事都沒有一樣和她閑聊。晚上エステル考慮再三決定向ヨシュア表達自己的愛意，不過在ヨシュア的房間卻沒看到他，這時傳來了ヨシュア吹奏的“星の在り處”，來到空中庭院找到了ヨシュア，他把自己的身世完完全全告訴了エステル，5年前的他是被稱作“漆黑之牙”的殺人兵器，他接到最后一個指令的暗殺目標就是エステル的父親カシウス，只不過雙方的實力懸殊實在是太大了，這一任務只能以失敗而告終，因此ヨシュア也遭到了身為殺手的同伴的追擊，反而是カシウス救了他并將他帶回家中收養，就這么渡過了5年的時光。其實ヨシュア也同樣對エステル懷有強烈的感情，但是為了カシウス和エステル的安全他決心離開他們父女，在親吻エステル的同時ヨシュア把即時生效的睡眠誘導劑送入了エステル的口中，エステル昏睡前聽見的最后一句話就是“再見，エステル”。

　　 整個游戲攻略可以說到此就全部結束了，不過故事還沒有完結，爆機之后玩家將會看到空之軌跡第二篇章的預告動畫，エステル將踏上尋找ヨシュア的全新旅途，屆時讓我們再來品味這一精彩的故事吧。

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